陈 越，陈 玲，张敦宇，肖素勤，殷富有，王玲仙，王 波，钟巧芳，付 坚，程在全

(云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所，云南省农业生物技术重点实验室，农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室，昆明 650205)

水稻(OryzasativaL.)是世界上一半以上人口的主要粮食来源，提供食物中60%～70%的能量和50%～60%的蛋白质[1]。近年来，为了增加稻农收入及解决人口不断增长带来的粮食需求问题，大幅度提高水稻单产被视为水稻育种的首要目标，大量农家地方品种被单一高产品种所替代，使得中国水稻品种单一化严重，大量优异基因丢失，遗传多样性大大下降，栽培稻遗传基础日益狭窄，育成的水稻品种对栽培环境的适应性较差[2-6]。

云南位于中国的西南边陲，其丰富的气候类型，复杂多样的生态条件及独特多彩的民族文化形成了云南独特的生物多样性和丰富的作物遗传资源。云南作为亚洲栽培稻的起源中心及生物多样性中心之一，是世界上最大的稻种遗传生态多样性中心，也是中国地方稻种的遗传多样性中心及优异稻种资源最富集的地区[7-12]。云南地方稻种资源的遗传多样性水平较高，而丰富的遗传多样性是实现水稻遗传改良的物质基础，目前研究种质资源遗传多样性通常采用分子标记的方法，SSR标记具有共显性、多态性好、稳定性高、操作方便且不易受外界环境影响的优点，近年来利用SSR标记技术分析云南水稻遗传多样性的报道越来越多。涂敏等[13]用24对SSR引物分析了云南永德、元阳、石屏、保山、玉溪及石林的160个水稻品种的遗传多样性，结果表明云南水稻品种的遗传多样性丰富，且地理来源不同的遗传差异明显。吕广磊等[14]对96份云南水稻种质资源的SSR遗传多样性分析表明，云南水稻地方品种具有极其丰富的多样性，含有大量可供育种选择的优异性状。董树斌等[15]对来自云南不同地区和村落的6个不同来源水稻品种的660份样本的遗传多样性分析表明，云南水稻传统品种在不同品种间、同一品种不同来源地及同一品种相同来源地间均具有较高的遗传变异，遗传多样性丰富。马孟莉等[16]用100对SSR标记对60份云南元阳哈尼梯田的红米资源进行遗传多样性分析，共获得477个多态性条带，平均每对引物扩增4.77个条带，平均山农多样性指数为1.016，研究表明云南哈尼梯田红米资源具有丰富的遗传多样性。这些研究结果都表明，虽然目前中国栽培稻品种丢失了一部分优异的等位基因，但云南地方水稻种质资源仍然具有较高的遗传多样性，是水稻新品种选育的宝贵资源。

本研究利用SSR标记对云南省作物种质资源库提供的908份覆盖云南16个州(市)的水稻种质资源的遗传多样性水平及群体结构进行分析，旨在从分子水平上了解云南省水稻种质资源的遗传变异及其群体结构，提高云南水稻种质资源的利用效率，拓宽栽培稻的遗传基础，为今后培育高原优质水稻新品种提供亲本材料。

1 材料与方法

1.1 材 料

供试的云南水稻种质资源由云南省作物种质资源库提供，共 908 份，包括保山市 89 份、楚雄州 17份、德宏州 44 份、大理州 17 份、迪庆州 9 份、红河州 97 份、昆明市 10 份、丽江市 27 份、临沧市 142 份、怒江州 21 份、普洱市 152 份、曲靖市 31 份、文山州 52 份、西双版纳州 77 份、玉溪市 63 份、昭通市 60 份。所有水稻材料于 2017 年 1 月单株种植在云南省元江县云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所的实验基地内，4 月采集幼嫩的水稻叶片带回实验室，在 40 ℃烘箱中烘干，保存于牛皮纸袋中，备用。

1.2 方法

1.2.1 水稻叶片的基因组DNA提取 用植物基因组DNA提取试剂盒(AXYGEN)提取 908 份水稻叶片的基因组DNA，使用核酸浓度测定仪和 12 g/L的琼脂糖凝胶电泳检测水稻叶片DNA的质量浓度和纯度，并将DNA母液稀释至 35 ng/μL，于-20 ℃保存，备用。

1.2.2 PCR扩增 根据水稻基因数据库公布的RM系列水稻引物，选取平均分布于水稻全基因组 12 条染色体上的 60对SSR引物(每条染色体上 5 对引物)，并以 32 份分别来自 16 个州(市)且表型差异较为明显的水稻种质材料对 60 对引物进行初筛，最终筛选出 22 对扩增稳定、重复性好、多态性较高的引物(平均每条染色体上 1～3 对，引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成)，用于云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析。提取的水稻基因组DNA在Biometra PCR仪上进行PCR扩增，PCR反应体系为 15 μL，包括 0.5 μL的上游引物(10 μmol/L)、0.5 μL的下游引物(10 μmol/L)、7.5 μL的 2×PCR Master Mix、4.5 μL的ddH2O及 2 μL的DNA模板。PCR反应流程为：94 ℃预变性 5 min；94 ℃变性30 s，55 ℃退火 30 s，72 ℃延伸 30 s，40 个循环；最后 72 ℃延伸 10 min，12 ℃保温。扩增产物用 6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，并通过硝酸银染色检测云南水稻种质间的多态性。

1.2.3 数据分析 根据PCR产物的聚丙烯酰胺电泳银染结果统计条带，在相同位置上，有带的记为“1”，无带的记为“0”，缺失的记为“9”，用Excel 2010整理数据，并根据不同的软件将数据格式进行相应转换。标记结果用Powermarker 3.25软件计算每对引物的等位基因数、主要等位基因频率、基因多样性指数及多态信息含量。利用POPGEN 32软件计算各个州(市)云南水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性指数、Shannon’s指数、群体内遗传分化程度、群体内基因多样性、群体间遗传分化系数、基因流、各个州(市)水稻种质之间的遗传距离和遗传一致性。用NTSYS-PC 2.1软件计算各个水稻品种间的Nei’s遗传距离，得到的遗传距离矩阵导入MEGA 5，以Neighbor-Joining法进行聚类分析，用iTOL对聚类图进行绘制美化，并用NTSYS-PC 2.1软件构建主成分分析图。利用Structure 2.3.4软件对 908 份云南水稻种质资源进行群体遗传结构分析。

2 结果与分析

2.1 SSR引物的遗传多样性分析

22 对引物对 908 份云南水稻种质资源的多样性分析见表 1，结果表明 22 对引物共检测到 193 个等位基因，每对引物检测到的等位基因数为4～18，平均为8.78，其中位于 12 号染色体上的引物RM2851检测到的等位基因最多，为 18 个，3 号染色体上的引物RM3585(11 个)、4 号染色体上的引物RM241(10 个)、5 号染色体上的引物RM163(13 个)、10 号染色体上的引物RM5348(13 个)及 11 号染色体上的引物RM1111(11 个)检测到的等位基因均在 10 个以上，而位于 2 号染色体上的引物RM5622检测到的等位基因最少，为 4 个。22 对引物的主要等位基因频率变幅为0.204 8～0.794 1，平均为 0.380 3，相差较大，其中 9 号染色体上引物RM205 (0.794 1)、11 号染色体上RM1111 (0.709 3)、2 号染色体上RM5622(0.667 4)、7 号染色体上RM234(0.590 9)和RM542(0.447 7)、6 号染色体上RM510(0.429 5)及3 号染色体上RM3585 (0.418 5)的等位基因频率均高于平均值，12 号染色体上引物RM2851最小，为 0.204 8。22 对引物的基因多样性指数为 0.347 7～ 0.887 6，平均为0.730 7，基因多样性较高；22 对引物扩增产物的多态信息含量为 0.320 2～0.877 7，所有引物中多态信息含量大于均值(0.698 6)的有 14 个，占63.64%，除9号染色体上引物RM205 (0.320 2)和 11 号染色体上引物RM1111 (0.458 5)为中度多态座位 (0.250.5的高度多态座位，表明本研究选取的 22 对引物具有较好的多态性，能够很好地 满足 908 份云南水稻种质的遗传多样性分析 需求。

表1 云南水稻种质资源的SSR引物遗传多样性参数Table 1 The genetic diversity parameter values of rice germplasm resources in Yunnan based on SSR primers

2.2 云南 16 个州(市)水稻种质资源的遗传多样性分析

以州(市)为单位，分析不同来源云南水稻种质的遗传多样性(表 2)。由表 2 可知， 22 对引物在所有水稻材料中均表现出多态性，多态性位点数和多态性位点百分率分别为65～160和 36.52%～89.89%，其中普洱市最高，迪庆州最低； 观测等位基因数为1.365 2～1.898 9，其中普洱市、临沧市、红河州和西双版纳州的观测等位基因数均在1.800 0以上，普洱市最多，而迪庆州和楚雄州相对其他州(市)较少，说明普洱市的水稻种质资源具有较高的多态性；有效等位基因数为 1.169 8～1.301 0，其中迪庆州水稻种质资源有效等位基因数与观测等位基因数最为接近，说明迪庆州水稻种质资源的等位基因在群体中分布最均匀；Nei’s遗传多样性指数为0.110 8～ 0.198 4，其中普洱市最高，其次是西双版纳州，而楚雄州的最低；Shannon’s 指数为0.177 4～ 0.321 9，除楚雄州(0.177 4)和迪庆州(0.193 0)外，其他州(市)Shannon’s 指数(I)为0.200 0～ 0.321 9，其中普洱市、临沧市和西双版纳州均在 0.300 0以上。以上结果表明，云南水稻种质资源在不同州(市)间遗传差异明显，普洱市、西双版纳州和楚雄州水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s 指数相对较高，其中普洱市的最高，以迪庆州和楚雄州最低，说明普洱市、西双版纳州和临沧市水稻种质资源的遗传多样性相对较高，16 个州(市)中普洱市水稻种质资源的遗传多样性最为丰富，而迪庆州和楚雄州相对较低。

表2 云南 16 个州(市)水稻种质资源遗传多样性情况Table 2 The genetic diversity of rice germplasm resources in 16 states(cities) of Yunnan province

2.3 云南 16 个州(市)水稻种质资源遗传距离与遗传一致度

遗传距离和遗传一致度是反应群体间亲缘关系远近的重要指标，当遗传距离为 1(一致度为 0)时，表明 2 个居群水稻种质完全不同，无亲缘关系；当遗传距离为 0(一致度为 1)时，表明 2 个居群水稻种质完全相同。由表 3 可知，云南 16 个州(市)的水稻种质资源遗传距离变幅较大，为0.010 3～0.074 3，其中楚雄州与昆明市的遗传距离最大，为0.074 3，普洱市与西双版纳州的遗传距离最小，为0.010 3。云南 16 个州(市)水稻种质资源遗传一致度为0.924 7～0.989 8，其中西双版纳州与普洱市的遗传一致度最高，为 0.9898，昆明市与楚雄州的遗传一致度最低为0.924 7，说明普洱市与西双版纳州水稻种质资源的亲缘关系较近，而昆明市与楚雄州的亲缘关系较远。

2.4 云南水稻种质资源的遗传分化分析

根据 22 个SSR位点所获得的数据来看(表 4)，908 份水稻种质资源遗传分化程度为 0.192 3，群体内基因多样性为0.163 5，群体间遗传分化系数为0.149 8，表明有14.98%的变异存在于水稻种质间，85.02%的变异存在于水稻种质内个体间，说明 908 份水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间。种质间的基因流为2.838 8，值大于1，表明在SSR分子标记水平上检测到的 908 份云南水稻种质间可能存在基因交流的情况。

表4 云南水稻种质的遗传分化分析Table 4 The genetic differentiation analysis of rice germplasms in Yunnan province

2.5 云南水稻种质资源的聚类分析

利用NTSYS-PC 2.1软件计算不同水稻材料间的Nei’s遗传距离，以Neighbor-joining法对908份云南水稻种质资源进行聚类分析。聚类分析结果表明，在遗传距离为0.001 4处，908 份云南水稻种质材料可分为两大类(图1中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ为第一大类，Ⅳ为第二大类)；而在遗传距离 0.01处，两个大类中的第一大类又被划分为 3 小类。由聚类图可以看出， 908 份云南水稻种质资源被划分为 4 类，其中第Ⅰ类含有 57 份云南水稻种质材料，占所有材料的6.3%，主要包括保山市的 17 份材料、楚雄州的 15 份材料、红河州的 10 份材料、昆明市的 1 份材料和曲靖市的 14 份材料。第Ⅱ类含有 71 份云南水稻种质材料，占所有材料的7.8%，主要包括保山市的 15 份材料、红河州的 1 份材料、临沧市的 9 份材料、普洱市的 2 份材料、曲靖市的 1 份材料、玉溪市的 2 份材料和昭通市的 23 份材料。第Ⅲ类含有 128 份云南水稻种质材料，占所有材料的14.1%，主要包括保山市的 31 份材料、迪庆州的 6 份材料、红河州的 21 份材料、昆明市的 1 份材料、丽江市的 8 份材料、临沧市的 1 份材料、怒江州的 16 份材料、普洱市的 3 份材料、玉溪市的 20 份材料和昭通市的 26 份材料，迪庆州和怒江州的水稻种质资源基本上都聚在此类群中。第Ⅳ类含有 652 份云南水稻种质材料，占所有材料的71.8%，主要包括保山市的 31 份材料、楚雄州的 2 份材料、大理州的 17 份材料、德宏州的 44 份材料、迪庆州的 3 份材料、红河州的 64 份材料、昆明市的 8 份材料、丽江市的 19 份材料、临沧市的 132 份材料、怒江州的 5 份材料、普洱市的 147 份材料、曲靖市的 17 份材料、文山州的 52 份材料、西双版纳州的 77 份材料、玉溪市的 23 份材料和昭通市的 11 份材料，该类群主要聚集了几乎所有的滇西南(临沧市、普洱市和西双版纳州)、大理州、德宏州和文山州的水稻种质资源。聚类分析结果表明，除德宏州和西双版纳州水稻种质资源全部分布于第Ⅳ类群中外，其他州(市)水稻种质资源交错分布于 4 个类群中，地理特征不明显，可能与长期进化过程中不同州(市)间水稻种质相互引种或品种交换所引起的基因交流有关。其中值得关注的是，虽然水稻种质并没有按来源地进行聚类，但同一类群内相同来源水稻种质聚集在一起，说明云南稻种资源遗传背景复杂多样，可能受云南立体气候和海拔的影响，同一地理来源水稻种质既相互关联又独立成群。

2.6 云南水稻种质资源的主坐标分析

本研究用NTSYS-PC 2.1软件构建 908 份云南水稻种质资源的三维主坐标分析(图 2)，主坐标分析可以更直观地将各个材料的亲缘关系在空间上展示出来。以第一主成分、第二主成分和第三主成分为三维坐标图的X、Y和Z轴，第一主成分、第二主成分和第三主成分分别反映 9.21%、3.64%和2.93%的变异。从图 2 可以看出，908 份云南水稻种质资源分为明显的 2 大类，2 大类内又可分为 4 个亚类，16 个州(市)的水稻种质没有按地理来源进行聚类，即每个类群都含有不同地理来源的水稻种质资源，同一地理来源的水稻种质资源也交叉分布于2个类群中，从PCA图中可以清晰的看出，PCA主成分分析与NJ聚类分析得出相同的结果，即云南水稻种质资源并没有按地理来源进化划分，地理来源相同的水稻种质资源交错分布于 2 大类群中，但在一个类群中来源相同的水稻种质资源聚集成簇。

图1 云南水稻种质资源聚类分析图Fig.1 Cluster diagram of rice germplasm resources in Yunnan province

图2 云南水稻种质资源的主坐标分析(PCoA)三维散点图Fig.2 The three dimensional scatter plot of principal coordinates analysis(PCoA) from rice germplasm resources in Yunnan province

2.7 群体结构分析

为验证NJ聚类和主成分分析的结果，进一步用Structure 2.3.4软件对 908 份云南水稻种质资源22对SSR引物的多态性标记结果进行群体遗传结构分析，设置分析群体数K为1～10，重复运行 5 次，从图 3-A中可以看出，随着K值的增加，LnP(D)值也持续增加。为了确定 908 份云南水稻种质资源的最优群体数，进一步参考Evanno等[17]报道的方法进行分析计算ΔK，由ΔK来确定最优群体数K，由图 3-B可以看出，当K=2时，ΔK最大(7 053.74)，出现明显的峰值，说明可以将 908 份云南水稻种质资源划分为 2 个类群(图4)，参考苏一钧等[18]的研究认为，在Structure群体遗传结构分析中，当某一材料的遗传组分(Q值)≥0.6表示该材料的遗传背景相对比较单一，而当Q值<0.6，则说明该材料的遗传背景较为复杂。分析云南水稻种质资源的Q值发现仅有 24 份资源(DY840、DY275、DY360、DY270、DY729、DY385、DY857、DY88、DY405、DY335、DY605、DY504、DY252、DY499、DY864、DY91、DY95、DY503、DY423、DY414、DY519、DY56、DY65和DY497)的Q值<0.6，说明这 24 份水稻资源的遗传组成较为复杂，没有明确归属于哪个类群，形成一个混合群体，而其余的 884 份水稻种质资源的Q值≥0.6，此部分资源的遗传结构较为单一，可以划在某一个类群中。第1类群(图 4 中红色的部分)含有云南 16 个州(市)的 602 份水稻种质资源，包括保山市 68 份、楚雄州 17 份、大理州 3 份、德宏州 32 份、迪庆州 8 份、红河州 80 份、昆明市 3 份、丽江市 10 份、临沧市 94 份、怒江州 16 份、普洱市 82 份、曲靖市 16 份、文山州 31 份、西双版纳州 44 份、玉溪市 48 份和昭通市 50 份；第 2 类群(图 4 中绿色的部分)含有除楚雄州和迪庆州外其他 14 个州(市)的 282 份水稻种质资源，包括保山市 16 份、大理州 7 份、德宏州 10 份、红河州 12 份、昆明市 7 份、丽江市 16 份、临沧市 48 份、怒江州 5 份、普洱市 70 份、曲靖市 15 份、文山州 20 份、西双版纳州 31 份、玉溪市 15 份和昭通市 10 份。Structure 2.3.4软件将 908 份供试材料划分为 2 大类，且所有的供试材料没有按照地理来源进行分类，分析的结果与NJ聚类分析和PCA主成分分析的结果基本一致。

图3 K值与LnP(D)和ΔK趋势变化图值Fig.3 The distribution of K-values with LnP(D) and K-values with ΔK

图4 云南水稻种质资源遗传结构分析Fig.4 Analysis on genetic structure of rice germplasm resources in Yunnan province

3 讨 论

本研究以覆盖水稻 12 对染色体上的 22 对SSR引物对云南省作物种质资源库提供的云南 16 个州(市)的 908 份云南水稻种质资源进行遗传多样性分析，22 对引物共检测到 178 个多态性位点，所选引物在所有水稻材料中均表现多态性，较好地反映了云南水稻种质资源的遗传多样性水平，研究结果表明云南 16 个州(市)水稻种质资源的遗传多样性差异较大，其中普洱市水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s 指数均较其他州(市)高，而迪庆州和楚雄州的相对较低，说明云南 16 个州(市)水稻种质资源中普洱市的遗传多样性最为丰富，而迪庆州和楚雄州的相对较低。研究结果与曾亚文等[19]以覆盖云南 16 个州(市)5 285 份地方稻资源的 31 个表型农艺性状研究的结果基本一致。云南 16 个州(市)水稻种质资源间遗传距离和遗传一致度分析表明，昆明市与楚雄州水稻种质资源的亲缘关系最远，普洱市与西双版纳州水稻种质资源的亲缘关系最近。对 908 份云南水稻种质资源的遗传分化分析表明，云南水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间。水稻种质间的基因流为2.838 8，基因流是产生进化的重要因素，也是决定群体内和群体间遗传多样性水平的重要因素，水稻基因流的大小主要与种子的传播密切相关，基因流越大则说明群体间基因交流越频繁[20-22]。前人的研究表明，频繁规律性的换种行为是丰富水稻地方品种遗传多样性的重要因素，云南农民历来就有种子互换和保留特定种子的传统，不同村落、不同地区及同一地区不同海拔之间同一品种不同种子的交换行为对于维持和丰富品种内遗传多态性具有重要意义[23-24]。本研究中908份云南水稻种质资源间的基因流值大于1，说明云南水稻种质资源间的基因交流较为 频繁。

近年来，用SSR标记对云南地方水稻品种的遗传多样性水平的研究报道越来越多。刘承晨等[25]对 47份云南哈尼梯田水稻材料进行多态性分析，118 对引物的等位基因数为2～4，平均每对引物2.161。陈于敏等[26]用SSR标记对 81 份云南常规粳稻品种的遗传多样性分析，结果表明所用的 48 对引物中仅有 37 对引物具有多态性，每对引物的等位基因数为2～10，平均每对引物 3.76。朱明雨等[27]对来自云南 17 个村落的 85份云南地方稻材料的遗传多样性分析结果表明，19 对SSR引物共检测到 83 个多态性条带，每对引物的等位基因数为3～7，平均每对引物4.37。董超等[23]利用SSR标记对 98 份采自元阳哈尼梯田 11 个村落的地方稻品种‘月亮谷’进行遗传多样性分析，结果表明 48 对引物共检测到 114 个等位基因，每对引物的等位基因数为1～4，平均每对引物2.38。张恩来等[28]在对 2007-2008 年间收集来自云南 56 个县(区)的 416 份地方水稻材料的SSR遗传多样性分析表明，20 对SSR引物共检测到 116 个等位基因，每对引物的等位基因数为3～13，平均每对引物5.8。本研究用覆盖水稻 12 对染色体上的 22 对SSR引物共检测到 193 个等位基因，每对引物的等位基因数为 4～18，平均每对引物8.78，明显高于前人对云南地方水稻品种的遗传多样性，说明本研究中云南省作物种质资源库提供的来自云南 16 个州(市)的 908 份水稻种质的遗传多样性水平较高，遗传背景丰富，在水稻新品种选育及拓宽栽培稻遗传基础的工作中具有重要意义。

本研究中 908 份云南水稻种质材料的NJ聚类图分析、PCA分析与Structure遗传结构分析的结果基本一致又相互补充，利用 22 对SSR标记可将所有供试材料分为 2 大类群，2 大类群又可分为 4 个亚群，聚类结果与地理来源没有相关性，不同州(市)水稻种质资源交叉分布于 4 个亚群中。与张晓丽等[29]对 316 份分别来自菲律宾、越南、老挝、柬埔寨和中国的地方稻材料分析得出东南亚国家水稻种质资源聚类与地理位置相一致的结论不同，李红宇等[30]也得出了与张晓丽等[29]相同的结论，认为东北三省 107 份水稻材料遗传距离与地理来源密切相关。而唐如玉等[31]用SSR分子标记对 81 份三峡库区不同来源水稻品种的遗传多样性分析认为，类群的划分与地理来源无明显相关性，相同地理来源的水稻种质交错分布于 2 个类群中，与本研究结论基本一致。樊传章等[32]对 196 份云南及国内外其他地区国家的粳稻资源的研究中也得出了与本研究一致的结论，对 196 份粳稻资源的聚类分析发现，云南的水稻资源交叉分布于 13 个类群中，而其他国家和地区的水稻资源的聚类则与地理来源密切相关，推测聚类的结果可能与发展与进化过程中云南不同州(市)水稻种质品种交换引起的基因交流有关，也进一步说明云南稻种资源的遗传多样性丰富。本研究中 908 份云南水稻种质资源的聚类结果虽然与地理来源无相关性，但相同来源水稻种质资源在一个类群内聚集在一起，说明云南稻种资源遗传背景较为复杂，可能受云南立体多样的气候和海拔跨度的影响，使同一来源的水稻种质资源既相互关联又独立成群。

本研究用 22 对SSR分子标记对 908 份来自云南 16 个州(市)水稻种质资源的遗传多样性进行分析，结果表明云南水稻种质资源具有丰富的遗传多样性，其中普洱市、西双版纳州及临沧市的遗传多样性高于其他州(市)。NJ聚类图分析、PCA分析和Structure遗传结构分析的结果表明，908 份云南水稻种质资源的聚类结果与地理来源没有明显的相关性，但在一个类群内相同来源的水稻种质资源聚集在一起。本研究结果为更好地利用云南水稻种质资源提供有利参考和依据，在今后水稻育种亲本选配、杂种优势的有效利用和创制高原特色水稻新品种方面有重要意义。