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甜瓜白粉病抗性基因遗传及候选基因定位

2019-09-19李冰赵玉龙朱强龙张志鹏樊超高鹏栾非时

中国瓜菜 2019年8期
关键词:白粉病单株抗性

李冰 赵玉龙 朱强龙 张志鹏 樊超 高鹏 栾非时

目的与意义:白粉病是甜瓜生产过程中的主要病害之一,在陆地和保护地均有发生,严重影响甜瓜的产量和品质,白粉病病原菌增殖快,传播迅速,防治困难。抗真菌药物不能完全抑制白粉病的发生,而且过多的施用会对环境造成危害。选育抗白粉病甜瓜品种是解决白粉病影响的重要方法。甜瓜白粉病存在多种病原真菌,并且存在多种生理小种,Podosphaera xanthii 小种1是国内引发甜瓜白粉病的主要生理小种之一,明确Podosphaera xanthii小种1侵染条件下甜瓜白粉病抗病遗传机制、定位抗病基因,是进行甜瓜白粉病抗性分子标记辅助选择育种的重要研究基础。

材料与方法:以葫芦科白粉病鉴别寄主中的高抗白粉病品种‘MR-1为母本,以高感白粉病品种‘TopMark为父本配制F1,F1自交配制F2分离群体;同时种植13份葫芦科白粉病鉴别寄主鉴定白粉病生理小种。在F2分离群体中分别选择高抗白粉病单株15株,高感白粉病单株15株,单株提取DNA,然后将抗病单株和感病单株DNA等量混合,送交公司进行全基因组重测序。对测序结果进行BSA分析得到控制甜瓜白粉病抗性基因存在的候选区间。通过分析候选区间内的SNPs,开发CAPS分子标记,根据这些标记对 346 株 F2 分离群体进行酶切检测,进行QTL分析,从而缩小候选区间。通过对候选区间内的SNP进行分析,对候选区间内的基因进行功能注释,初步确定候选基因。

结果与分析:(1)本研究基于13份鉴别寄主对白粉病的抗性反应,确定了白粉病生理小种为Podosphaera xanthii小种1。親本MR-1和F1对Podosphaera xanthii小种1完全免疫,而TopMark对Podosphaera xanthii小种1表现出严重的易感性。F2代中抗性个体和易感个体之间呈现出3∶1的分离比例。这一结果表明,MR-1对Podosphaera xanthii 小种1的抗性受单一显性基因控制。(2)通过对亲本以及F2群体极端单株建池全基因组重测序数据进行BSA分析,甜瓜抗白粉病基因被定位到了12号染色体21 223 056~23 736 859 bp之间。(3)在候选区间内一共鉴定出424个SNP位点,进而开发了80个CAPS标记,其中25个标记在亲本间存在多态性。利用这25个标记对346个F2单株进行基因分型,构建一个49.7 cM的遗传连锁图谱,平均遗传距离为2.0 cM。通过进行QTL分析将抗病基因定位在标记BSA12-LI3ECORI和BSA12-LI4HINFI之间,将该位点命名为Pm12.1,该位点距两端标记的遗传距离分别为0.02 cM和0.28 cM。两标记之间物理距离为77.97 Kb,物理位置为22 804 825 至 22 882 791 bp。(4)在77.97 Kb的候选区间内一共存在17个基因,通过对候选区间内的SNP进行分析,发现存在25个非同义突变SNP分布在7个基因的外显子区域,初步将这7个基因确定为候选基因,通过对这7个基因进行功能注释,其功能分别为锚蛋白重复家族、富甘氨酸细胞壁结构蛋白、F-box蛋白和两个未知蛋白。

结    论:本研究中通过BSA,NGS以及广泛应用于不同植物材料进行基因定位的经典的QTL分析法进行甜瓜抗白粉病基因定位。本研究发现了一个遗传规律为单基因显性的甜瓜抗Podosphaera xanthii 小种1抗性基因,并将其定位在很小的遗传距离内,并且预测了7个基因作为甜瓜抗白粉病候选基因。

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