韩雨昕, 南芳茹, 巩超彦, 冯佳, 吕俊平, 刘琪, 谢树莲



弯枝藻属L基因的适应性进化分析

韩雨昕, 南芳茹, 巩超彦, 冯佳, 吕俊平, 刘琪, 谢树莲*

(山西大学生命科学学院，太原 030006)

为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征，选取弯枝藻属()及相近外类群的L基因共17条，利用PAML 4.9软件，对弯枝藻属L基因编码蛋白进行生物信息学分析，并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测。结果表明，弯枝藻属L基因编码蛋白的二级结构主要由螺旋和折叠构成，结构稳定。采用最大似然法构建的系统发育树表明，内类群为单一物种，分为3个小分支，具有一定地理分布规律。在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点，表明绝大多数位点处于负选择压力下。因此，弯枝藻属L基因未发生适应性进化。

弯枝藻属；L基因；蛋白质结构预测；适应性进化

红藻主要分布于海洋中，淡水分布的红藻只占一小部分，有研究表明, 淡水红藻是海洋红藻在海陆变迁过程中遗留于淡水中，并在封闭环境中经过长时间演化而产生的一个重要类群[1]。淡水红藻大部分以固着方式生活在温度较低的清洁水体中的岩石或其他物体上，生存环境相对稳定和封闭[2–3]。弯枝藻属()是淡水红藻中的典型类群之一，早在190多年前就有记载，在世界上分布广泛，北美、加勒比群岛、西大西洋、亚洲、澳大利亚和夏威夷群岛等均有分布[4]。Necchi等[5]认为该属不同种样本间的遗传多样性较低，为一全球单种属。……