李慧，马德志，姜明，刘溪，陈晓婷，刘振艳

(齐齐哈尔医学院医药科学研究院，黑龙江 齐齐哈尔 161006)

传统中药继承了数千年历史精华的积累，在现代疾病预防和治疗方面具有自身的优越性和特点。随着质谱色谱技术的快速进步，促进了中药有效成分的发现与鉴定，然而尚有许多中医药理论缺少现代自然科学的支撑和验证[1]。随着人类基因组计划的完成，人类探索生物的发展规律进入了后基因组时代，转录组学、蛋白组学和基因组学等逐渐被广泛应用。其中转录组学的应用最为广泛，发展也最为迅速，不仅是研究细胞表型和功能的重要手段，也是研究基因结构、基因功能及表达的新的研究方法[2]。广义的转录组(Transcriptome)是指生物体细胞或组织在特定状态下所转录出来的所有RNA的总和，包括能够编码蛋白质的RNA(即mRNA)和不能编码蛋白质的RNA(rRNA,tRNA,microRNA等)。狭义的转录组指所有编码蛋白质的mRNA总和。

近年来，随着DNA高通量测序技术的飞速发展，大规模测序技术(如Roche公司的454 GS-FLX、Illumina公司的Genome Analyzer II和ABI公司的AB SOLiD))的出现彻底颠覆了转录组研究的方式，由传统的基因芯片技术发展到RNA测序技术(RNA-seq)，也称为转录组测序技术。该技术以高通量的方式揭示特定时间、特定组织或细胞中基因的全部表达情况、测定转录水平的SNP/Indel/SSR等遗传多态性情况、识别相同基因的选择性剪切或拼接情况、检测未知基因等。目前，RNA-seq技术已成功应用于动物、植物、微生物等各类生物当中。在动物(例如：半番鸭[3]、黄牛[4]、山羊[5]等)研究中主要涉及到疾病研究、关键基因发掘及基因剪切等方面。……