基于MIMLNN的玉米蛋白质功能预测
2018-10-22陈彦明
现代计算机 2018年25期
关键词:功能
陈彦明
(上海海事大学信息工程学院,上海 201306)
0 引言
谷物及其制品,提供了人类40%-70%的食品[1],玉米是世界上最主要的谷物,大约1万年墨西哥南部的土著人首先种植了玉米[2],现今玉米已成为世界许多地区的主食,总产量超过小麦、大米。然而,并不是所有的玉米都直接被人类消费,一些玉米用于生产乙醇、动物饲料和其他玉米产品,如玉米淀粉和玉米糖浆。谷类对人体健康有非常重要的积极影响,玉米中的纤维素和植物化学素等成分对人体而言具有良好的营养保健作用。
对玉米的蛋白质功能进行注释以便对它功能蛋白的生理意义进行理解,对于玉米蛋白质组学的研究显然非常重要。在世界上较为主流的蛋白质序列数据库中,已有一定量的经人工注释复核的玉米蛋白质数据可供使用,但同时仍有大量未经注释且功能未知的玉米蛋白质序列。面对这些没有经过注释且功能未知的玉米蛋白质,显然手工注释的方法已经跟不上数据的脚步,非常需要一种自动化的方法来对玉米的蛋白质进行功能预测。
在这样的时代背景下,不管是从玉米蛋白质研究的角度来说,还是从玉米对于我国经济社会发展的重要性来说,研究使用计算机技术实现对玉米的蛋白质自动化地进行功能预测具有不言而喻的现实意义。而机器学习技术的兴起发展为解决此类问题提供了一种优秀的解决方案,其中一部分技术则非常适合解决此类预测问题。……
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