孙吉 张坤驰

摘 要：随着高通量测序技术的日渐成熟，技术原理和材料工程不断创新，基础科研在临床诊疗中的应用日趋广泛，NGS在癌症基因组学研究领域中的应用越来越广泛。最近，NGS已被用于临床肿瘤学以促进癌症的个体化治疗。本文列举了高通量测序技术在临床上的肿瘤诊断、治疗及预后方面的主要指导作用，并展望了其在肿瘤领域的应用前景。

关键词：高通量测序；肿瘤；诊治；预后

1 NGS的简介

高通量测序技术（Next Generation Sequencing，NGS）是近年来发展成熟的一项前沿技术，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。[1] NGS是对传统测序一次革命性的改变，使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，通常包括样本前处理、测序文库构建、数据分析解读等，所以也被称为深度测序（Deep Sequencing）。[2]

2 NGS的主要平台

测序技术包括多种方法，基本的原理都是在DNA 进行PCR 扩增时，借助一些化学标志物在碱基插入DNA 链时发出的信号来读取序列信息。大体上它们可被组合为模板制备、测序和成像以及数据分析，可以通过特定方法的独特组合将不同的平台区分开，并从每个平台产生的数据确定其种类。而各平台有其不同的原理、优点及局限性，如Illumina/Solexa 平臺应用可逆链终止物和合成测序法，其价格低廉且通量高数据量大，局限是仪器和用于分析的费用高昂；Life/Solid平台应用连接测序法，准确度高、成本低，不过读长短、测序时间长；Roche/454平台应用焦磷酸测序法，准确度达99%以上，在第二代中具有最高读长并且比第一代的测序通量大，但无法测量同聚物的长度；……