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12个新城疫病毒分离株的F基因和HN基因序列分析

2018-10-12曹梦蕊李荣旭谭华龙陈济铛张溢珊刘敏芳陈建红张济培

动物医学进展 2018年9期
关键词:分析

曹梦蕊,李荣旭,谭华龙,陈济铛,张溢珊,刘敏芳,陈建红,张济培

(佛山科学技术学院生命科学与工程学院,广东佛山 528231)

新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)属于副黏病毒科副黏病毒属,3′-NP-P-M-F-HN-L-5′构成其基因组,共编码6种蛋白[1]。其中F蛋白和HN蛋白为NDV的囊膜蛋白,在病毒感染宿主细胞和识别受体的过程中起到重要作用,同时与NDV的抗原性和免疫原性相关[2-3]。

新城疫(Newcastle disease,ND)是由新城疫病毒引起的禽呼吸道、消化道黏膜严重出血的一种传染病,是养禽业极为重视的传染病之一[4-5]。据报道,我国家禽感染NDV的病例报道越来越多,不仅表现在鸡群的感染情况,且水禽感染NDV的发病率、病死率逐渐升高,并以逐年增加的趋势向全国大部分地区蔓延[6-8]。本研究旨在对分离获得的12株NDV的F基因和HN基因进行分子遗传进化分析,从而了解广东部分地区NDV遗传进化情况。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 毒株 12株NDV由佛山科学技术学院禽病研究所分离、鉴定和保存,各毒株具体信息见表1。

1.1.2 引物设计 参考GenBank中的NDV全基因组序列,用Primer 5.0软件设计扩增F基因和HN基因的引物。本试验2对引物分别扩增出大小为2 653 bp和2 100 bp的2个片段,片段序列分别包含了F基因与HN基因开放阅读框。

1.2 方法

1.2.1 病毒RNA提取和RT-PCR扩增 12株病毒总RNA抽提严格按照TransZol Up Plus RNA Kit说明书进行,并按照反转录试剂盒(PrimeScriptTMⅡ 1st Strand cDNA Synthesis Kit)的使用说明书进行反转录,其产物进行各毒株F基因和HN基因的PCR扩增,PCR产物经10 g/L琼脂糖凝胶电泳检测分析。

1.2.2 序列测定及同源性分析 选取PCR扩增阳性产物回收纯化,与pMD18 T-Vector 16℃连接4 h,连接产物转化到感受态细胞中,于……

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