1981年11月27日，在房山区云居寺石经山雷音洞内出土的这两颗佛舍利，根据当年一同出土的石函铭文记载，是隋炀帝赐予云居寺来保存，可是在铭文当中提到安置佛舍利三颗，佛舍利在经历了1400多年之后为什么现存的却只有两颗呢？丢失的一颗佛舍利究竟去往何方？

云居寺有宝藏

说到云居寺的石经，这里还有一些有趣的故事，云居寺石经山山腰分两层，凿有九个藏经洞，雷音洞为第五洞。九个藏经洞中，存放从隋朝到明朝的刻经石板41%6块，在第六洞的门楣上方有“宝藏”两字，这个是明代的大书法家董其昌所写。据史料记载，明朝崇祯年间，在北京做官的官吏、居土刊刻了200块石经送到了石经山珍藏，在雷音洞旁边开辟了一个小洞，董其昌看到石经山藏经之艰辛、工程之浩大，称赞之余，写下了“宝藏”两字。

不过他写这个“藏”字少了几笔，一是因为董其昌的书法风格所致，二是寓意宝贝就要藏起来，是一种暗示。

北京史研究会理事杨亦武介绍，佛舍利可能是萧皇后所赐，放舍利和佛教渊源有关： “放舍利是三宝俱全的意思，过去讲是三宝之地，是佛、法、僧，佛是释迦牟尼的舍利，法是经文、佛经，僧是僧人。”佛舍利从隋朝安放在云居寺石经山雷音洞内，一共出土过两次，第一次出土是在明代万历二十年，杨亦武介绍第一次佛舍利的出土和明末四大高僧之一的达观真可有关：“他看见这里石经脫落了，荒肆不堪，就让东云居寺主持派僧人修缮，碎石搬开发现了佛舍利青石函。石函里是一寸大的银函，银函里面是半寸左右大小的金函，金函里面有个非常小的金瓶，金瓶里是三颗小米粒大小紫红色的舍利。慈圣皇太后把它迎进宫中，虽然记载中慈圣皇太后供奉了三天。直到1981年，我们才知道是明人动了手脚。”在明代万历年间，慈圣皇太后把三颗佛舍利请进宫中，供奉了两个多月才归还云居寺。1981年当佛舍利在雷音洞中再次被发现时，却少了一颗。这究竟是怎么回事呢？

无意中发现佛舍利

又过了约四百年，1981年11月，在中国社会科学院宗教研究所读研究生的罗炤，为撰写论文，在云居寺遗址进行科学考察，他曾看到过935年4月日本出版的《东方学报》第五册副刊上，有一篇京都大学学者冢本善隆写的学术论文《山云居寺研究》，是冢本善隆在1934年带领调查团赴房山考察石经山时的报告，里面提到了石经山藏有佛舍利，罗炤仔细查对了下历史资料和学术文章，都没有房山云居寺藏有佛舍利的记载，他初步判断云居寺应该藏有佛舍利，而后人并不知道。为了进一步对佛舍利进行挖掘，罗炤第一时间给当时人云居寺管委会主任的田福月写了一封信，没想到这封信起到了关键作用，得到了田福月主任的大力支揭开了佛舍利神秘面纱。

1981年11月25日，倒了云居寺。田月和他详谈了很长时间，制定了一个初步计划。第二天一早，下着小雪，罗炤和田福月委派的名叫梅傲工直奔石经山。走到判l腰经过施荼亭遗时，就看到了两尊石碑。这次，罗特地查看了衢在南那块石碑上果然写着冢本文章中提的事。这块石进步证实了他的推测。

罗炤先前进入雷音洞都没太注意地面，因此这次他特意留心腳下。洞内地面由青石板铺成，走到大约正中位置时，他发现了方方正正的一块黄土地。前几天洞里维修，罗炤拿起工人师傅落下的把铁锨：”我就取过来，沿着边沿掘那块黄土，发现土下面也是一块石板，大概一米二见方，比其他地方低了约三五公分，上面的黄土显然是洞顶落下来的灰尘积聚起来的，根本撬不动。”田福月马上派人向房山县文化科汇报当天，房山县文化科科长王建中就派崔宝华和房山县文物保管所所长沈书权赶到了云居寺，这时田福月从附近召集了几位民工，制作好了撬石板用的导链、麻绳和木头杠子。

第二天，罗炤一行人带着工具来到了雷音洞内。石板缓缓撬起来后，下面是一块自然的巨石，但正中凿出了一个一米见方的地穴，里面赫然摆放着一只汉白玉石函，上面“万历”字样清晰可见！

揭开函盖后，里面又是一只暗青色的石函周身雕满纹饰。揭开盖子，拿上来一看，背面又是几行字，上书“大隋大业十二年岁次丙子四月丁巳……于此函内安置佛舍利三粒……”等字样。青石函里填满了黑色粉末状或块状的东西还有香味，明显是香料。把香料拨开，里面是一只更精美的玉石函，上面的字迹有”慈圣皇太后（万历皇帝生母）”等。罗昭等人把所有石函取出拍照记录，把东西运下山去。

到了云居寺，打开玉函，里面居然还有一只银函，又是隋代遗物。根据明代记录，舍利显露出来，会放出灿烂的金光，一直等到半夜12点罗炤等人才小心翼翼地打开银函，最里层还有一只羊脂玉小函揭开最后一层盖子，里面是两颗小米大小的红色颗粒，一旁还有两颗打了眼的珍珠——灿若金光的景象并未出现

丢失的佛舍利成谜案

令罗炤高兴不起来的是，佛舍利竟然少了一颗：”依照青石函的字迹，佛舍利本该有三颗而且按明代记载，最里层本是一只金瓶。我们推测，可能是佛舍利在明代送入皇官时，被皇太后拿走了一粒，替换成自己项链上的两粒珍珠，而金瓶也被她换成了羊脂玉小函。这是全世界唯一没有存放在塔里的佛舍利。据记载，明代时曾在上面雕了一座弥勒佛像。雷音寺本就是座佛殿，所以，明代之前，上面最有可能是尊佛像，但也不能完全排除是塔的可能。”是不是慈圣皇太后私藏了一颗佛舍利与自己同葬，已经成为了历史疑案。

此后云居寺又经历了明代的农民起义、清朝入关、民国建立、抗战爆发到1942年日军轰炸房山，云居寺毁于一旦，后来仅存北塔和山门。据说日本人当年号称拆南塔修攻防设施，其实也是想发掘佛舍利。

使消失在历史尘埃中的舍利再次重见天日这是个重大的考古发现这两粒舍利太珍贵了。云居寺不具备保存条件，舍利开始保藏在北京的银行金库里，后来保藏在首都博物馆，其间曾三次回云居寺做短时展出。舍利发瑯的经过，罗炤神态从容淡定，认为一切都是老天安排他去发现，我可不敢贪天之功啊。”