沈清清，陈红惠，刘 芳

（1.文山学院 环境与资源学院，云南 文山 663099;2.文山学院 化学与工程学院，云南 文山 663099）

根瘤菌（rhizobium）广泛分布于土壤中，属革兰氏阴性菌，传统观念认为根瘤菌是一类从豆科植物根部入侵并与之共生后形成根瘤，能行使自身固氮功能的细菌[1]。近年来，随着多基因序列分析与全基因组序列测定等分子技术的发展和多种分类方法的推广，根瘤菌的分类学研究发生了巨大的变化，例如新的属种不断推出、对属种的命名和划分产生许多争议，特别是新的研究报道根瘤菌不仅包含共生固氮细菌，同时也包含了非共生固氮的细菌[2]，这一发现彻底颠覆了人们对根瘤菌传统观念上的认识。

目前，根瘤菌主要依据16S rRNA的系统发育学分析来确定其菌种的分类地位，但在16S rRNA全序列分析存在一些缺陷，一方面16S rRNA具有高保守性可能会限制种以下的分类，另一方面由于生物间存在基因水平转移的现象，仅依赖16S rRNA的分析会使分类体系产生偏差或混乱[3]。因此有必要提出或补充根瘤菌菌种鉴定更为可靠的方法和依据。FtsZ蛋白是一类微管蛋白，与细胞分裂密切相关，几乎存在于所有的原核和真核生物中，研究发现原核生物与真核生物的FtsZ蛋白在进化上由共同祖先进化而来，具有保守性，适合于细菌系统分类学研究[4]。张斌等[5]将FtsZ 蛋白应用于乳酸菌的系统分类研究中，发现FtsZ 蛋白序列的分辨率高于16S rRNA， 更适用于乳酸菌种间的系统分类研究。

本文从NCBI中调取了根瘤菌6个属共29个菌种的FtsZ 蛋白，从FtsZ 蛋白的角度对根瘤菌进行系统发育学研究，探讨根瘤菌物种之间的进化关系，并与最新的根瘤菌分类情况进行了比较。……