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试论基于支持向量机的枯草杆菌启动子预测技术

2018-06-07

时代农机 2018年3期
关键词:特征研究

胡 震

(景德镇陶瓷大学,江西 景德镇 333000)

枯草杆菌是革兰氏阳性菌中比较有代表性的模式生物,启动子作为RNA聚合酶结合的靶序列,其预测和分析对于研究枯草杆菌的基因序列关系有着非常重要的作用。利用高精度的预测算法能够有效地补充传统实验中对于枯草杆菌的相关研究。支持向量机在解决小样本、非线性及高维模式识别中表现出许多特有的优势,因此,利用支持向量机的方法展开针对枯草杆菌的启动子预测和分析,正是文章探讨的中心内容。

1 研究的重要意义

枯草杆菌(又名枯草芽孢杆菌)虽然是革兰氏阳性菌中比较典型的一种菌株,但是应用其制备发酵制品的时候,该菌株是非致病的。又因为其具备自身合成消化性酶类(如蛋白酶、纤维素酶),可以在消化道中与内源酶发生共生作用,合成多种维生素,提高和人动物体内的干扰素和巨噬细胞活性的诸多特点,美国的FDA和中国农业部等相关部门都认可批准其是安全级的食品菌株。有相关研究表明,枯草杆菌可以改善血清总胆红素值,能够用于治疗新生儿的母乳性黄疸和子宫肌瘤等妇幼疾病。因此,把枯草杆菌作为一种益生菌积极应用进入医疗卫生行业,能够有效提高人类的生命质量,维护人类健康。

而要想把枯草杆菌进行大规模的工业开发,基因工程技术的应用就显得尤为重要。启动子是基因表达中的一个重要调控序列,能够在DNA转换成RNA时发挥重……

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