沈莉芳,张 弛,吴家雪

(复旦大学 生命科学学院，上海200438)

ADP-核糖基化是一种在高等真核生物中普遍存在的蛋白翻译后修饰．该修饰由ADP-核糖基转移酶家族的成员催化，从底物β-NAD+转移ADP-核糖部分到受体蛋白上，从而调节这些蛋白的功能．ADP-核糖基团可以以单个的ADP-核糖(MAR)或以聚合链多聚ADP-核糖(PAR))的形式存在．目前已经发现PAR在染色质重塑、DNA损伤修复、基因转录、蛋白质降解和细胞死亡中发挥重要作用[1-3]．

PAR的功能除了调节底物外，还可以作为介导两个蛋白之间相互作用的平台起作用．例如，许多DNA损伤应答因子，如ALC1[4-5]和CHFR[6]在DNA损伤时能够被招募到DNA损伤位点，这种募集作用取决于它们与DNA损伤位点上被PAR修饰蛋白的结合，并且能被ADP-核糖基转移酶(poly(ADP-ribose)polymerases, PARPs)抑制剂抑制．这种相互作用主要由PAR和PAR结合结构域的结合来介导．目前已经报道了一些PAR结合结构域．这些结构域包括Marco结构域[4]，WWE结构域[7]，PAR结合锌指结构域(PBZ)[6,8-10]，BRCT结构域[11]，FHA结构域[11]，OB-折叠结构域[12]，PIN结构域[13]和RNA识别基序(RRM)[14]．

鉴定PAR修饰蛋白或PAR结合蛋白对于探索PAR的功能非常重要．但是由于目前大规模检测PAR修饰位点技术的缺乏，在文献和数据库中报道的PAR修饰蛋白或PAR结合蛋白还比较少．基于质谱的蛋白质组学已经成为鉴定复杂的PAR结合蛋白的关键技术[15-17]．最近有研究表明利用抗体，PAR结合结构域或NAD+类似物沉淀相关的PAR修饰蛋白，并进行质谱分析可以得到大量的PAR修饰或者PAR结合蛋白[18-22]．然而，通过这些方法鉴定的蛋白绝大部分是被PAR修饰的蛋白，缺少直接与……