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基于SNP标记的短须裂腹鱼自然群体遗传多样性分析

2018-03-30李光华金方彭武祥伟吴俊颉高海涛张文魁

水生生物学报 2018年2期

李光华 金方彭 周 睿 武祥伟 吴俊颉 冷 云 高海涛 张文魁

(1. 云南省渔业科学研究院, 昆明 650111; 2. 云南农业大学, 昆明 650000)

SNP是指在基因组水平上由单个核苷酸碱基的转换或颠换引起的DNA序列多态性, 由于基因组DNA的任何碱基均有可能发生变异, 所以SNP几乎遍布整个基因组, 是动植物中普遍存在的一种分子标记; SNP具有数量多、分布广泛、代表性强、遗传稳定性好、便于高通量、高度自动化检测分析等优点, 通过研究其在生物基因组中的分布即能够全面地反映群体的遗传及变异水平[1]。

短须裂腹鱼[Schizothoraxwangchiachii (Fang)]隶属于鲤形目(Cypriniformes)鲤科(Cyprinidae)裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)裂腹鱼属(Schizothorax),分布于金沙江水系, 且其肉质细嫩, 味道鲜美, 是金沙江及其所属支流的主要经济鱼类之一[2]。短须裂腹鱼也是金沙江中游龙开口水电站和阿海水电站进行增殖放流的土著鱼类之一。因此, 短须裂腹鱼具有相对较高的经济价值与生态价值[3]。但近年来, 因其栖息地建设水坝, 栖息环境遭破坏, 加之人类活动影响等原因致使短须裂腹鱼的自然种群资源量急剧下降。目前, 对短须裂腹鱼的研究主要集中在人工驯养、人工繁殖[4]、幼鱼行为学[5]、胚胎发育和仔鱼早期发育特性研究[6]等方面, 还未见短须裂腹鱼的SNP标记开发与遗传多样性水平的研究报道。

本文采用SLAF-seq技术开发了短须裂腹鱼的SNP标记, 并进一步分析了金沙江短须裂腹鱼自然种群的遗传多样性水平。本研究为短须裂腹鱼的种质资源保护与开发利用提供了有效工具及理论依据。……

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