（中国水产科学研究院黑龙江水产研究所，淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室，黑龙江 哈尔滨 150070）

地球上大约有3 000种硬骨鱼类，据联合国粮食及农业组织（FAO）统计，养殖水产物种近400种。水产养殖业是农业领域发展最迅速的分支之一，随着水产养殖业的快速发展，产业中出现一系列问题，如产量、肉质和抗逆性下降、病害严重、性早成熟等，需要对水产养殖动物进行遗传改良和选育，而了解表型变异的遗传基础是最大的生物学挑战。大多数的表型性状是由多个数量性状位点（QTL）等位基因分离导致的数量遗传变异引起[1]。这种基因型-表现型复杂的关系包括环境的效应，应将标记辅助选择育种和自然群体的适应性变异给出重要的解释[2,3]。过去几十年对动植物的大量研究就是为了剖析基因型-表现型之间的关系。水产养殖动物的经济性状多为数量性状，传统的选育方法难以做到准确选择，需要借助各种分子生物学手段，如构建遗传连锁图谱进行QTL定位和性状-标记间关联分析等，发掘与重要经济性状相关的基因和标记，开展标记辅助育种，以提高育种效率[4]。

有关酵母、果蝇、小鼠和斑马鱼Danio rerio等模式生物的基因型-表现型关系的研究很多[5]。近年来，高通量测序技术的优势和应用使非模式物种的相关研究发展很快[6,7]，连锁图谱和QTL定位在水产养殖物种中的研究也快速提升，使养殖鱼类重要性状的QTL研究取得了喜人的成果[8]。本文综述了近年来几种主要养殖鱼类QTL研究的现状及存在问题，并展望了未来发展趋势。……