吴运谱

(辽宁省动物疫病预防控制中心，辽宁 沈阳 110164)

流感病毒作为一种全球性的、重要的公共卫生安全威胁。根据世界卫生组织估计，全球每年约有300万～500万流感患者，并导致了大约29万～66万人死亡。基于Web查询，IRD可以免费使用，可为流感病毒数据和分析提供一站式服务，并促进关于流感病毒传播、毒力、宿主范围和致病性及其新的诊断策略、预防和治疗干预措施等方面的发展。

1 IRD的构成

1.1 IRD数据来源

IRD的数据由来源于GenBank（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/）和UniProt（http://www.uniprot.org）序列数据和序列注释数据和免疫表位数据库（IEDB；http://www.iedb.org）的免疫表位数据和蛋白质数据库 (PDB;http://www.rcsb.org/pdb)的蛋白质三维结构数据等方面数据组成。临床监测和宿主因素的数据来源于直接提交和治疗时抗病毒药物来自于药物数据库（http://www.drugbank.ca）。

1.2 分析及可视化的工具

包括多序列比对、进化树重构、变异序列确认、适宜于序列元数据的序列比较分析工具（meta-CATS）、BLAST比较、短肽鉴定、PCR引物设计、基因序列注释、序列特征和表型变异型注释（Phenotypic Variant Type,PVT）、HA分支分类、HA亚型间的编号换算、检测数据的可视化和蛋白结构的可视化和宿主因子数据富集分析。

1.3 个人数据存储空间

个人数据存储空间的推出和使用极大地吸引了用对该数据库的使用，IRD对流感研究重要性的正在逐渐增加，其使用量的稳步增加是很好证明。据《流感和其他呼吸道病原》杂志也报道了IRD数据库论文是该杂志2014年度的应用中排名第一。

2 IRD的功能

2.1 自定义元数据获取工具

IRD允许用户使用进化树查看器对基于序列关联元数据的进化树节点进行着色，包括对地理分布、宿主种类、分离株年份和季度、HA和NA亚型、在特定蛋白质位置上出现的特定氨基酸等特征进行着色标记。……