高天翔，陈 治，王晓艳

（1.浙江海洋大学水产学院，国家海洋设施养殖工程技术研究中心，浙江舟山 316022；2.中国海洋大学水产学院，山东青岛 266003）

传统鱼类多样性调查方法具有诸多缺点[1-2]。近年来，以PCR、定量PCR及DNA条形码技术为基础，结合第二代高通量测序技术的环境DNA分析被广泛地应用于生态学研究中[3-6]。该方法直接从环境样品中提取DNA，采用定量检测、生物信息学分析等手段，实现对样品中所存在物种的有效检测，在近海鱼类多样性调查方面具有重要的实际意义和良好的应用前景。

1 环境DNA分析技术的概念及产生背景

生物多样性是维持生态平衡、促进人与自然和谐发展的重要成分，是生态系统稳定的关键因素，也是生态系统对环境变化响应与适应的重要指标。准确掌握水生生物在水体环境中的生物量及其时空分布是开展水生生物物种多样性保护的基本前提和重要基础[3]。以往的鱼类多样性调查主要采用围网、拖网、电鱼等传统研究方法[1-2,7-9]。这些调查方法普遍具有以下缺点：（1）调查费用高、所需时间久。水生生物调查，不仅需要准备网具、租赁船只，还需配备完整的调查人员和船舶驾驶人员。燃油动力费及人员劳务费亦是传统资源调查难以缩减的开支。一般性的鱼类多样性调查，少则几天，多则数年。费用高、时间久是传统调查方法的一个显著缺点[8]。（2）目标生物捕获率低[8-9]。水生生物，尤其是以鱼类为代表的水生游泳动物，往往具有较强的游动性，在水域出现的位置是不固定的。……