左柯+胡建平+杜文义+梁立+刘嵬+苟小军

摘要： HIV-1整合酶（HIV-1 IN）是目前开发抗艾滋病药中最具潜力的药物靶点之一，四聚体是该蛋白发挥生物学功能的主要聚集体形式。为了得到IN四聚体与病毒DNA的复合物，并研究其运动性与生物学功能的关系，采用同源模建、结构优化及叠落等方法，在Tn5转座酶的基础上建立了IN-DNA的复合物模型，并采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究四聚体的运动模式。Ramachandran Plot分布和Profile-3D结果验证了复合物模型的合理性。运动模式结果表明，四聚体的N-端、C-端的运动有利于螯合DNA，而核心区的稳定状态是IN发挥整合作用的前提。分子对接结果表明，IN抑制剂更偏向于结合在四聚体中间CCD与病毒DNA结合的区域。

关键词： HIV-1整合酶四聚體；病毒DNA；高斯网络模型；各向异性网络模型；分子对接

中图分类号： R918-39 文献标志码： A

文章编号：1002-1302（2017）22-0032-06

艾滋病（acquired immune deficiency syndrome，简称AIDS）是由人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus，简称HIV）[1]感染引起的具有较强传染性的一种疾病，据世界卫生组织（world health organization，简称WHO）统计[2]，截至2014年，全球有超过3 800万人感染了艾滋病，其中受灾最严重的是非洲，平均1 000个5岁以下的儿童中有95个患有艾滋病。近年来，在亚洲，尤其是中国的艾滋病患者也越来越多了，因此研究抗艾滋病药物刻不容缓。

HIV-1整合酶（integrase，简称IN）是HIV病毒生命周期中不可缺少的酶之一，能够通过3′-端加工（3′-processing，简称3′-P）和链转移（strand transfer，简称ST）2步反应，将病毒DNA整合到宿主DNA上，形成新的DNA，并随着宿主DNA的复制而复制[3-5]。因此，HIV-1整合酶是开发抗艾滋病药物的重要靶点。HIV-1 IN是由288个氨基……