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基于EMR的乳腺肿瘤知识图谱构建研究

2018-01-03陈德华乐嘉锦

计算机应用与软件 2017年12期

崔 洁 陈德华 乐嘉锦

1(东华大学旭日工商管理学院 上海 200051) 2(上海交通大学医学院附属瑞金医院计算机中心 上海 200025) 3(东华大学计算机科学与技术学院 上海 200051)

基于EMR的乳腺肿瘤知识图谱构建研究

崔 洁1,2陈德华3*乐嘉锦3

1(东华大学旭日工商管理学院 上海 200051)2(上海交通大学医学院附属瑞金医院计算机中心 上海 200025)3(东华大学计算机科学与技术学院 上海 200051)

知识图谱作为一种描述实体及其联系的新方法,在医学领域也逐渐得到关注,出现了多种医学知识图谱。但是这些医学知识图谱的知识大多来源于公开的医学文献,较少涉及到EMR电子病历。EMR电子病历涵盖了医院各科室各病种的患者诊疗全过程数据,具有丰富的医疗事实知识,是医学知识图谱的重要知识来源。为此,以乳腺肿瘤这一具体病种为应用实例,结合知识图谱技术的基本原理,给出了乳腺肿瘤知识图谱的定义;结合上海交通大学医学院附属瑞金医院的实际EMR电子病历数据集,通过知识抽取技术从EMR中提取乳腺肿瘤医疗事实知识。在此基础上提出乳腺肿瘤知识图谱的构建方法。

EMR 乳腺肿瘤 知识图谱 信息转化

0 引 言

EMR电子病历记录了医院各科室患者在诊疗过程中所产生的各种数据,包括患者基本信息、诊断数据、检验数据、检查数据、用药数据、出院小结等。这些数据反映了医院内部真实发生的各种医疗事实,例如“某患者经超声检查被诊断为乳腺癌IV期”则包含了两种类型的医疗事实,即该患者的检查事实和诊断事实。……

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