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西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长的克隆及其表达分析

2017-12-28陈芬芳张凤英马春艳马凌波

海洋渔业 2017年6期
关键词:分析

宋 炜,陈芬芳,2,张凤英,马春艳,赵 明,马凌波

(1.中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;2.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306)

西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长的克隆及其表达分析

宋 炜1,陈芬芳1,2,张凤英1,马春艳1,赵 明1,马凌波1

(1.中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;2.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306)

采用RACE技术获得西伯利亚鲟(Acipenser baerii)Sox17基因cDNA全长,序列分析表明,西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长2 671 bp,包括588 bp的5’端非翻译区,901 bp的3’端非翻译区和编码393个氨基酸残基的1 183 bp开放阅读框。氨基酸序列比对显示,该基因具较高的保守性,与塞内加尔多鳍鱼(Polypterus senegalus)的相似度最高为72%。系统进化分析表明,西伯利亚鲟与塞内加尔多鳍鱼聚为一支,且支持率为95%。以延伸因子efla(elongation factor 1-alpha)作为内参基因,对Sox17基因在西伯利亚鲟各组织的相对表达量进行分析,发现Sox17基因在不同组织中均有表达,但表达具有明显的组织差异性。在脑中表达量最高,而在肾、血液、眼、肠和胸鳍5个组织中表达量均较低。同时,Sox17基因在西伯利亚鲟不同发育时期均有表达,但表达具有一定的时间差异性。在宽神经板期的表达量高,相当于表达量最低点11日龄仔鱼的167倍。本研究为量化西伯利亚鲟胚胎发育分化过程中相关基因提供了参照工具,同时可为今后深入研究西伯利亚鲟Sox17在胚胎发育过程中的作用提供基础参考资料。

西伯利亚鲟;Sox17;cDNA全长;……

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