不同物种TYR基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析
2017-12-13郭敏李祥龙
郭敏 李祥龙
摘要:利用生物信息学方法对13個物种TYR基因编码蛋白的理化性质,以及一级、二级、三级结构和亚细胞定位进行预测和分析,同时拟构建13个物种TYR基因的系统发育树。结果表明:TYR基因编码产物为不稳定蛋白(貉子除外),整条多肽链表现出亲水性。二级结构主要为α螺旋、β折叠,β转角区域分布少且散,均存在信号肽和跨膜区,可以判断TYR基因编码蛋白是定位于生物膜上的膜蛋白或分泌蛋白,主要在嘌呤和嘧啶、运输和结合、电压门控离子通道及转录中发挥作用。各物种TYR基因编码产物主要定位于内质网、高尔基体以及细胞质膜。除原鸡外,其他物种该蛋白均存在跨膜区,貉子有2个跨膜区域。各物种系统发育树与动物学进化观点基本一致。
关键词:物种;酪氨酸酶基因;毛色;蛋白质结构;生物信息学
中图分类号: Q754文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2017)21-0044-05[
[HJ14mm]
收稿日期:2016-06-01
基金项目:河北省高校创新团队领军人才培育计划(编号:LJRC004);河北省应用基础研究计划重点基础研究项目(编号:15962901D);河北省自然科学基金重点项目(编号:C2016407114)。
作者简介:郭敏(1991—),女,内蒙古呼和浩特人,硕士研究生,研究方向为功能基因组学。E-mail:1908384796@qqcom。
通信作者:李祥龙,博士,教授,博士生导师,研究方向为动物遗传育种。E-mail:lixianglongcn@yahoocom。
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