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镇江地区诺如病毒分子流行病学特点及基因型分析*

2017-12-13许金凤徐虹宋寅生薛渊邵世和申红星

临床检验杂志 2017年11期

许金凤,徐虹,宋寅生,薛渊,邵世和,申红星

(1.江苏大学医学院,江苏镇江 212013;2.镇江市疾病预防控制中心检验科,江苏镇江 212000)

·研究生园地·

镇江地区诺如病毒分子流行病学特点及基因型分析*

许金凤1,2,徐虹2,宋寅生2,薛渊2,邵世和1,申红星1

(1.江苏大学医学院,江苏镇江 212013;2.镇江市疾病预防控制中心检验科,江苏镇江 212000)

目的分析2015-2016年镇江地区诺如病毒(NoV)的分子流行病学特点及基因型分布。方法收集镇江地区腹泻患者粪便标本,逆转录PCR(RT-PCR)检测NoV衣壳蛋白基因的表达水平,并对PCR产物行基因测序验证; Mega软件构建系统进化树,并进行序列进化和基因型分析。结果NoV总阳性率为5.30%(85/1 605),GⅠ组检出率为0.87%(14/1 605),GⅡ组检出率为4.55%(73/1 605),其中2份样本同时检出感染GⅠ/GⅡ。GⅡ组在10~20岁组中的阳性率最高(17.80%)。2015年NoV的检出率以1月最高,11月、2月次之;2016年以12月最高,3月、4月次之。2015年NoV的基因型以新GII.17型变异株为主(63.89%),2016年以GII.4 Sydney_2012株为主(35%)。结论镇江地区的NoV以GII组为主,青少年患者阳性率高,主要流行季节为11月至次年4月,主要流行基因型为GII.17型变异株和GII.4 Sydney_2012株。

诺如病毒;分子流行病;基因型

诺如病毒(Norovirus, NoV)属于杯状病毒家族,是引起非细菌性胃肠炎的重要原因之一[1]。目前,NoV已逐渐成为导致世界范围内人群腹泻的主要原因[1]。NoV病毒存在地区及人群的差异性[2-3],为充分了解镇江地区肠道NoV感染的分子流行病学特征及基因型状况,本研究采集了2015-2016年的镇江地区腹泻人群的标本及临床信息,并进行检测和序列测定等分析,以期探究其分子流行病学特点及基因型分布。

1 材料与方……
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