APP下载

低温离体保存黄独微型块茎转录组、蛋白质组和代谢组的关联分析

2017-12-06洪森荣吴夏俊鹏徐文慧占学林谢妮妮汪金华吴丽霞

浙江农业学报 2017年11期
关键词:差异分析

洪森荣,吴夏俊鹏,徐文慧,占学林,谢妮妮,蒋 妍,汪金华,凌 飞,吴丽霞,万 琳

(上饶师范学院 生命科学学院,江西 上饶 334001)

低温离体保存黄独微型块茎转录组、蛋白质组和代谢组的关联分析

洪森荣,吴夏俊鹏,徐文慧,占学林,谢妮妮,蒋 妍,汪金华,凌 飞,吴丽霞,万 琳

(上饶师范学院 生命科学学院,江西 上饶 334001)

为探究黄独微型块茎低温离体保存的内在机理,对其转录组、蛋白质组和代谢组进行关联分析。结果表明:黄独微型块茎低温和常温离体保存的转录本比例和蛋白比例的log2值均呈现正态分布,十分类似,符合真实生物样品的要求;差异蛋白和差异转录本韦恩图结果表明,84个转录本在两者中均有差异,表明大多数差异的转录本在蛋白组数据均有差异;差异蛋白和差异转录本的log2对数热图分析结果表明,相对于蛋白质组来说,转录组差异程度更大,两者的差异转录本多数一致,少数不同;差异蛋白和差异转录本log2散点关联密度图分析结果表明,两者的比例在0附近居多,左下角和右上角(转录本和蛋白的上下调关系一致)相对左上角和右下角(转录和蛋白上下调关系不一致)更多,表明两者差异表达趋势一致性的程度更高。低温离体保存黄独微型块茎转录组、蛋白质组和代谢组的关联分析结果表明,低温离体保存的黄独微型块茎主要涉及碳代谢、氨基酸生物合成、糖酵解途径、淀粉蔗糖代谢和丙酮酸代谢等途径,这为黄独微型块茎的低温离体保存和低温破除休眠提供了理论依据。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

差异分析
相似与差异
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
找句子差异
DL/T 868—2014与NB/T 47014—2011主要差异比较与分析
电力系统不平衡分析
生物为什么会有差异?
电力系统及其自动化发展趋势分析
M1型、M2型巨噬细胞及肿瘤相关巨噬细胞中miR-146a表达的差异
中西医结合治疗抑郁症100例分析
收入性别歧视的职位差异