赵腾腾 杨雪雨 董珂珂 朱小蕾

乙酰胆碱酯酶AChE与1，7-二氮杂咔唑抑制剂的作用机理的分子动力学模拟

赵腾腾 杨雪雨 董珂珂 朱小蕾＊

（南京工业大学化工学院，材料化学工程国家重点实验室，南京 210009）

通过分子对接、分子动力学（MD）模拟以及成键自由能分析方法,从原子水平上模拟研究了3种1,7-二氮杂咔唑衍生物（分别记为M1、M2和M3）与AChE的结合模式及相互作用机理,分析和讨论了研究体系的静电相互作用和范德华相互作用（vdW）。用MM-PBSA方法计算的3种抑制剂与AChE之间的结合自由能与抑制剂的实验生物活性数据（IC50值）相对应。分析结果表明,残基S286与抑制剂之间形成的氢键作用有利于抑制剂与AChE之间的结合。范德华相互作用,尤其是抑制剂与关键残基W279和Y334的作用,对抑制剂与AChE之间的结合自由能有较大的贡献,在区分抑制剂M1（或M2）和M3的生物活性上发挥着重要的作用。

阿尔茨海默症；乙酰胆碱酯酶；1,7-二氮杂咔唑类抑制剂；分子动力学模拟；MM-PBSA

众所周知,世界正面临老龄化问题,阿尔茨海默病（AD）的发病率随着年龄的增加而显著增加。阿尔茨海默症病人的主要表现为认知功能障碍［1]、记忆缺失及语言障碍［2-3]等神经精神症状。迄今为止,阿尔茨海默病本质上可能的病因是基底前脑胆碱能神经递质的缺陷,尤其是乙酰胆碱（ACh）的大量缺失［4-6]。胆碱酯酶包括乙酰胆碱酯酶（AChE）和丁酰胆碱酯酶（BChE）,其主要作用是使胆碱能神经递质水解。在ACh的水解酶作用下［7],ACh将被水解为胆碱和乙酸,从而引起阿尔茨海默症。……