血清白蛋白与降血糖药物相互作用的关键位点分析
2017-11-01金能智齐燕姣者建武赵志威
生物信息学 2017年3期
金能智,齐燕姣,者建武,赵志威
(1.甘肃省计算中心,兰州 730030;2.西北民族大学榆中校区 化工学院,兰州 730124)
血清白蛋白与降血糖药物相互作用的关键位点分析
金能智1*,齐燕姣2,者建武1,赵志威1
(1.甘肃省计算中心,兰州 730030;2.西北民族大学榆中校区 化工学院,兰州 730124)
用生物信息学的方法分析不同物种的血清白蛋白的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇和伏格列波糖与人血清白蛋白相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点。结果表明米格列醇、伏格列波糖与人血清白蛋白的结合位点都位于人血清白蛋白亚区IB的疏水腔中,其间的主要作用力是氢键和疏水作用力。米格列醇和伏格列波糖与血清白蛋白结合位点处的氨基酸在其他物种中大部分都是保守的,只有少数的氨基酸不同,且极性也不相同。血清白蛋白疏水性分析发现米格列醇和伏格列波糖与血清白蛋白结合位点处的氨基酸中亲水性的较多,疏水性的少,在其他4个亲缘关系较近的物种也具有同样的现象。这些分析结果为进一步研究降血糖药物在其他物种中的表现及相互作用等提供了重要的科学依据。
米格列醇;伏格列波糖;血清白蛋白;序列比对;亲缘关系
血清白蛋白(serumalbumin,SA)是一种球状蛋白质,是机体循环系统中含量最丰富的储存与运输蛋白。该蛋白有许多重要的生理学与药理学功能,能与许多内源和外源性物质如脂肪酸、氨基酸、荷尔蒙、K2阴阳离子和药物等结合[1]。……
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