祁思敏，宋勇春，崔仑标，焦永军，祁贤

1. 南京大学生命科学学院，南京 210093； 2. 江苏省疾病预防控制中心，南京 210009； 3. 浙江省中医药大学药学院，杭州 310053

·论著·

1株H6N6亚型禽流感病毒分子遗传特性分析

祁思敏3，宋勇春1，崔仑标2，焦永军2，祁贤2

1. 南京大学生命科学学院，南京 210093； 2. 江苏省疾病预防控制中心，南京 210009； 3. 浙江省中医药大学药学院，杭州 310053

本研究采用无特定病原体(specific pathogen free，SPF)鸡胚，从某活禽市场环境中分离出1株H6N6亚型禽流感病毒(A/environment/Zhenjiang/zj18/2013，en/zj18)。通过二代测序技术进行全基因组测序，通过BLASTn 进行同源性检索，并采用MEGA5.0软件构建系统发生树。基因进化树分析表明，分离株en/zj18的所有8个基因节段(PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M和NS)均与近年来中国华东地区流行的H6N6亚型禽流感病毒的相应基因位于同一进化分支，与参考株的核苷酸同源性达96.7%～99.6%。分离株en/zj18的HA蛋白裂解位点为PQIETR↓GL，是低致病性禽流感病毒的分子特征。HA蛋白上关键受体结合位点190和228位(按H3亚型的HA蛋白序列排序)氨基酸分别是E和G，理论上更易与α2，3-半乳糖苷唾液酸受体结合。结果提示，需加强活禽市场禽流感病毒的持续监测，从而为有效应对禽流感病毒对公共卫生的持续威胁提供科学依据。

禽流感病毒；H6N6亚型；病毒分离；基因组测序

甲型流感病毒(influenza A virus)属正黏病毒科，基因组由8个节段的单股负链RNA组成。RNA可编码的蛋白包括RNA聚合酶(PB1、PB2和PA)、血凝素(hemagglutinin，HA)、神经氨酸酶(neuraminidase，NA)、核蛋白(nuclear protein，NP)、基质蛋白(M1和M2)、非结构蛋白(NS1、NS2/NEP、PB1-F2等)。HA和NA是病毒粒子的两个重要表面糖蛋白，根据其抗原性差异，甲型流感病毒可分为不同亚型。作为甲型流感病毒的主要自然储存宿主，野生水禽中已发现16种HA亚型和9种NA亚型。……