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利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq

2017-11-01陈峰徐建第姜明松张全芳朱文银李广贤周学标杨连群

山东农业科学 2017年10期
关键词:水稻检测

陈峰,徐建第*,姜明松,张全芳,朱文银,李广贤,周学标,杨连群,

(1.山东省水稻研究所,山东 济南 250100;2.山东省农业科学院生物技术研究中心,山东 济南 250100)

利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq

陈峰1,徐建第1*,姜明松1,张全芳2,朱文银1,李广贤1,周学标1,杨连群1,2

(1.山东省水稻研究所,山东 济南 250100;2.山东省农业科学院生物技术研究中心,山东 济南 250100)

Wx-mq基因是水稻低直链淀粉性状控制基因,与米饭食味品质密切相关。本研究根据水稻控制低直链淀粉含量Wx-mq基因第497位存在的G>A单核苷酸变异,将基于SYBR GreenⅠ的ARMS和Tm-shift的两种实时PCR基因分型方法相结合,建立了可准确区分Wx-mq基因第497位的GG纯合、AA纯合及GA杂合三种类型的实时荧光定量PCR体系。试验表明这种基于SYBR GreenⅠ的ARMS-Tm-shift实时PCR基因分型方法无需合成探针,试验设计简单,是一种快速、简便、特异性好的基因分型方法,可用于Wx-mq基因分子标记辅助育种中基因的高通量分型。

水稻;Wx-mq基因;低直链淀粉含量;ARMS-Tm-shift-qPCR

近年来, 随着人民生活水平的提高, 消费者对稻米食味品质的要求越来越高。研究表明,直链淀粉含量是决定米饭质地和食味品质的重要因素[1,2]。低直链淀粉含量的水稻其米饭表面光泽透亮,综合了糯米的柔软性和粳米的弹性, 适口性好,食味品质佳,具有较高的商品性。

水稻低直链淀粉基因Wx-mq是通过化学诱变剂N-甲基-N-亚硝基脲处理日本水稻品种越光而获得的低直链淀粉含量变异基因,序列分析表明,与来自野生型亲本越光中的Wx基因相比,Wx-mq在编码区发生了……

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