APP下载

雄激素受体在乳腺癌中的生物信息学分析

2017-10-09JinhuaWang

山西中医药大学学报 2017年3期
关键词:关联乳腺癌分析

李 兵,杜 岗,Jinhua Wang

(1.山西省煤炭工业厅煤矿职业病防治中心,山西 太原 030012; 2.暨南大学附属第一医院,广东广州 510632;3,Center for Health Informatics and Bioinformatics,New York University School of Medicine,New York,NY,USA;4.Laura and Isaac Perlmutter Cancer Center,New York University School of Medicine,New York,NY,USA)

雄激素受体在乳腺癌中的生物信息学分析

李 兵1,杜 岗2,3,Jinhua Wang3,4

(1.山西省煤炭工业厅煤矿职业病防治中心,山西 太原 030012; 2.暨南大学附属第一医院,广东广州 510632;3,Center for Health Informatics and Bioinformatics,New York University School of Medicine,New York,NY,USA;4.Laura and Isaac Perlmutter Cancer Center,New York University School of Medicine,New York,NY,USA)

目的:通过数据挖掘探讨雄激素受体(AR)在乳腺癌中发病的机制,探索协同表达基因网络中的潜在干预靶点和信号通路。方法:分别从TCGA数据库和NCBI数据库中下载了两个独立的乳腺癌基因表达谱数据,筛选出AR的关联基因,使用Cytoscape平台中的ClueGo插件对这些基因进行生物信息学分析。结果:以Pearson相关系数>0.40或<-0.40为阈值,共发现21个基因与AR有强的相关性,其中负相关4个,正相关17个;同时发现基因MLPH,SYT17,PIP,ALCAM,TOX3在既往文献报道中较少,可以成为下一步的研究方向。GO功能分析提示AR及其关联基因与上皮细胞分化、细胞形态改变、细胞内的类固醇激素受体信号通路等有关。结论:AR在乳腺癌作用中的信号通路和分子机制复杂,基于乳腺癌的数据挖掘可以为乳腺癌的个体化诊断和治疗提供科学依据。

乳腺癌;雄激素受体;生物信息学

乳腺癌是影响女性健康的主要恶性肿瘤之一,在欧美国家发病率较高,中国的发病率也呈快速增长趋势[1]。乳腺癌呈激素依赖性,雌激素、孕激素及其受体在乳腺癌的发生、发展中起着重要作用;内分泌治疗已经成为雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)阳性患者的一线治疗方法[2]。然而,绝经后女性体内雌激素的减少并未……

登录APP查看全文

猜你喜欢

关联乳腺癌分析
绝经了,是否就离乳腺癌越来越远呢?
“苦”的关联
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
乳腺癌是吃出来的吗
胸大更容易得乳腺癌吗
电力系统不平衡分析
别逗了,乳腺癌可不分男女老少!
智趣
电力系统及其自动化发展趋势分析
语言学与修辞学:关联与互动