无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析
2017-09-18曾德龙高成伟秦新民
野生动物学报 2017年1期
关键词:物种
秦 峰 曾德龙 高成伟 秦新民
(广西师范大学生命科学学院,桂林,541004)
无蹼壁虎线粒体全基因组及系统发育分析
秦 峰 曾德龙 高成伟 秦新民*
(广西师范大学生命科学学院,桂林,541004)
稿件运行过程
无墣壁虎; 线粒体基因组; 系统发育
无蹼壁虎(Gekkoswinhonis)属壁虎科(Gekkonidae)壁虎属动物,主要分布于辽宁、河北、陕西、河南、山东、江苏、安徽、浙江、广西等地,常见于暖温带以及栖息在建筑物的缝隙、岩缝、石下及树上。无蹼壁虎为我国的特有物种,该物种已被列入中国国家林业局2000年8月1日发布的《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》。人们对无蹼壁虎的形态、生态、行为,以及药用价值等方面进行过研究[1-6],但其线粒体基因组和系统发育的研究尚未见报道。本文对无蹼壁虎的线粒体基因组进行了测序和基因组结构特征分析,并对无蹼壁虎的系统发育进行了探讨。
1 材料与方法
1.1 材料
无蹼壁虎,采集于广西壮族自治区防城港。取其尾部肌肉为实验材料 。
1.2 方法
1.2.1 总DNA提取
DNA提取方法参照汪永庆等[7]报道的SDS/蛋白酶K裂解法进行。
1.2.2 引物设计、PCR 扩增及序列测定
本研究中部分PCR引物参考已公布的线粒体基因组扩增通用引物[8],其余通过从Genbank下载壁虎科、蜥蜴科(Lacertidae)的线粒体基因组全序列或部分序列用软件Clustal X 1.83比对,以找到合适保守位点,设计出含简并位点的引物。部分引物无法扩增出产物,待其他片断序列完成后用Primer Premier 5.0设计特异性引物,使所设计的引物能够扩增出覆盖无蹼壁虎的线粒体全基因组序列(表1)。……
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