孟丽，陶洁，李本强，马玉飞，程靖华，张春玲，刘惠莉

1 上海市农业科学院畜牧兽医研究所，上海种猪工程技术研究中心，上海 201106 2 上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306

猪7种腹泻相关病毒的临床检测及猪嵴病毒的遗传进化分析

孟丽1,2，陶洁1，李本强1，马玉飞1,2，程靖华1，张春玲1，刘惠莉1

1 上海市农业科学院畜牧兽医研究所，上海种猪工程技术研究中心，上海 201106 2 上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306

孟丽, 陶洁, 李本强, 等. 猪 7种腹泻相关病毒的临床检测及猪嵴病毒的遗传进化分析. 生物工程学报, 2017, 33(8):1292-1303.

Meng L, Tao J, Li BQ, et al. Clinical detection of seven porcine diarrhea-associated viruses and evolution analysis of porcine kobuvirus. Chin J Biotech, 2017, 33(8): 1292-1303.

为了解引起猪腹泻疫病的病毒性病原种类及感染现状，本研究首先针对 7种报道较少但可引起猪腹泻的病毒性病原建立了多重RT-PCR检测方法，包括猪捷申病毒 (PTV)、猪萨佩罗病毒 (PSV)、猪丁型冠状病毒 (PDCoV)、猪嵴病毒 (PKV)、猪札幌病毒 (PSaV)、猪星状病毒 (PAstV)和猪环曲病毒 (PToV)。利用该方法对419份临床腹泻粪便样品进行筛检，结果显示PKV检出率最高，阳性率达26.98%–45.79%；PKV和其他病原混合感染率达9.52%–18.54%。基于PKV的高检出率及其可能在猪腹泻疾病中发挥的作用，本试验进一步选取3个PKV阳性样品进行全基因组序列测定及遗传进化分析。结果表明，这3个阳性样品PKV均归属于猪嵴病毒属，且与其他动物嵴病毒遗传距离较远，分别标记为CM-PKV、JS-PKV和PD-PKV；它们的全基因组同源性为88.1%–89.1%；CM-PKV与2013年报道的中国株JS-02a-CHN/2013同源性最高，而JS-PKV和PD-PKV则与2008年报道的匈牙利株K-30-HUN/2008/HUN同源性最高。表明上海不同地区猪群中存在的PKV有明显的遗传差异，但毒株遗传特性的差异与其致病力的相关性需进一步研究。……