毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达
2017-08-16程占超马艳军
程占超,侯 丹,马艳军,高 健
(国际竹藤中心 国 家林业局竹藤科学与技术重点开放实验,北京100102)
毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达
程占超,侯 丹,马艳军,高 健
(国际竹藤中心 国 家林业局竹藤科学与技术重点开放实验,北京100102)
生长素反应因子(ARF)基因家族在植物的生长发育中起至关重要的作用。关于毛竹Phyllostachys edulis ARF基因家族在花器官中生物信息学分析未见报道。以毛竹花器官为材料,采用生物信息学的方法,对毛竹中ARF基因进行筛选,并对其系统进化关系、保守基序及在花器官中的差异表达模式进行了初步的分析。结果表明:毛竹全基因组中含有44个ARF基因,分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ类。与拟南芥Arabidopsis thaliana和水稻Oryza sativa分别比较,发现毛竹与水稻存在11个姐妹同源基因对。此外,PheARF13,PheARF14和PheARF35在花芽、雌蕊和幼胚中高量表达,同时PheARF2,PheARF30,PheARF14,PheARF13,PheARF35,PheARF7,PheARF37,PheARF38在雌蕊和幼胚中高量表达,推测这些基因可能在花发育和种子发育中发挥重要的作用。图3表1参32
林木育种学;毛竹;生长素应答因子;花发育
植物生长激素能够调节或者影响植物不同的生理过程,比如顶端优势、侧根萌发、导管分化、胚胎发育和芽的伸长,也可以促进细胞的分裂、延伸和分化[1]。在分子水平上,生长素能够特异性地调节基因的表达[2]。生长素信号转导相关的3类主要蛋白是Aux/IAAs,ARFs和SCF复合体[3-4]。作为生长素信号途径一个重要的成员,ARFs基因能够通过结合生长素启动子上的AuxRE来调控生长素反应基因的表达[5]。这些ARFs基因调控不同的发育过程,比如顶芽形成,导管组织的形成,胚胎、花和果实的形成[6]。……
