基于空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型
2017-08-07林元震张卫华张心菲张鑫鑫
林元震,张卫华,程 玲,张心菲,张鑫鑫,
(1 华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东 广州 510642;2 广东省林业科学研究院,广东 广州 510520)
基于空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型
林元震1,张卫华2,程 玲1,张心菲1,张鑫鑫1,2
(1 华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东 广州 510642;2 广东省林业科学研究院,广东 广州 510520)
【目的】建立空间效应与竞争效应的分析模型,以提高林木遗传评估的准确性. 【方法】利用R软件及其程序包breedR模拟数据,结合实测数据,采用XFA1结构拟合加性效应、近邻竞争效应和AR1结构拟合空间效应,建立随机区组设计模型(RCBM)、空间模型(SM)、空间与测量误差模型(SUM)和空间与竞争模型(SCM),运行ASReml估算遗传参数,进行模型比较。 【结果】对于模拟数据,估计的参数结果均显示 SCM是最优模型,其大大降低了随机误差方差,随机误差方差分别由7.56(RCBM)、5.72(SUM)降低到3.13(SCM),分别降低了58.6%、45.3%,并估算到四周近邻竞争方差;SCM模型估算的单株狭义遗传力在0.40左右,高于RCBM(0.24)和SUM模型(0.30);设置参数的不同初始值,SCM估计的参数结果均较为稳定;对于实测数据,估算结果与模拟结果比较一致。 【结论】SCM模型是新的单株混合模型,可用于林木遗传分析。
空间效应;竞争效应;单株混合模型;REML;遗传分析
Key words:spatial effect; competition effect; individual-tree mixed model; REML; genetic analysis
林木遗传改良通常需在田间试验基础上,估算参试样本(种源、家系、单株或无性系)目标性状的遗传参数,并运用一定的评价方法筛选出具有优异目标性状的种源、家系或无性系[1]。……
