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鲤疱疹病毒3型焦磷酸测序检测方法的建立

2017-07-18郑树城李莹莹曾伟伟王英英石存斌

生物学杂志 2017年3期
关键词:检测

郑树城, 王 庆, 李莹莹, 曾伟伟, 王英英, 刘 春, 石存斌

(1. 中国水产科学研究院 珠江水产研究所 农业部渔药创制重点实验室 广东省水产动物免疫技术重点实验室, 广州 510380; 2.上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306)

鲤疱疹病毒3型焦磷酸测序检测方法的建立

郑树城1,2, 王 庆1, 李莹莹1, 曾伟伟1, 王英英1, 刘 春1, 石存斌1

(1. 中国水产科学研究院 珠江水产研究所 农业部渔药创制重点实验室 广东省水产动物免疫技术重点实验室, 广州 510380; 2.上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306)

为了针对鲤疱疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus 3, CyHV-3)建立一种基于焦磷酸测序技术的高通量、自动化、快速的检测方法,根据CyHV-3ORF55、ORF79和ORF92基因保守区域设计特异性PCR扩增引物和测序引物,进行PCR扩增筛选扩增效率最高的引物。PCR灵敏性和特异性试验结果显示,针对ORF79设计的引物扩增效率最高,最低检测量为100个拷贝数,且能特异性识别CyHV-3;将PCR产物进行焦磷酸测序,获得的序列经BLAST比对显示与CyHV-3-U、I、J和GZ11分离株一致性均为100%。该检测方法方便快速,适用于出入境口岸大批量样品CyHV-3诊断检测。

鲤疱疹病毒3型;锦鲤疱疹病毒;焦磷酸测序;检测

鲤疱疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus 3,CyHV-3),又称为锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus, KHV)、鲤鱼间质性肾炎及鳃坏死病毒(Carp interstitial nephritis and gill necrosis virus, CNGV),是引起鲤鱼和锦鲤高度传染性锦鲤疱疹病毒病(Koi herpesvirus disease, KHVD)的病原[1-3]。该病一般发病于春秋季节,发病温度为18℃~28℃,患病鱼常出现食欲不振、两眼凹陷、体色发黑、腹腔和鳃出血、鳃发白、皮肤出现白色斑点、黏液分泌过多等症状[4-5]。该病自从1997年在德国首次报道以来,全球多个国家报道了由鲤疱疹病毒3型引起的鲤鱼或锦鲤大量死亡的现象[6-7]。……

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