基于SSR标记的木荷核心种质构建*
2017-07-18杨汉波王帮顺徐肇友周志春
杨汉波 张 蕊 王帮顺 徐肇友 周志春
(1.中国林业科学研究院亚热带林业研究所 浙江省林木育种技术研究重点实验室 杭州 311400;2.浙江省龙泉市林业科学研究院 龙泉 323700)
基于SSR标记的木荷核心种质构建*
杨汉波1张 蕊1王帮顺2徐肇友2周志春1
(1.中国林业科学研究院亚热带林业研究所 浙江省林木育种技术研究重点实验室 杭州 311400;2.浙江省龙泉市林业科学研究院 龙泉 323700)
【目的】 通过对比分析与评价以确定木荷核心种质构建的最适取样策略和比例,并构建木荷核心种质; 在此基础上,进一步建立核心种质分子身份信息,为木荷种质资源的深入研究和加强利用、发掘优异基因资源提供理论依据和核心材料,同时也可为其他多年生木本植物核心种质的构建提供参考。【方法】 利用13对SSR引物,以来自7个省(市)29个地区的754份木荷种质资源为材料,利用M策略(M)、随机取样法(R)、遗传多样性最大化法(SAGD)和等位基因最大化法(SANA)分别构建核心种质。采用等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)和Shannon’s信息指数(I)等遗传多样性指标进行比较分析来确定最适合的构建方法。【结果】 13对SSR引物共检测到128个等位基因(Na),平均有效等位基因数(Ne)为3.47,Shannon’s信息指数(I)为1.39,表明木荷种质资源具有丰富的遗传多样性。SANA、SAGD和M策略构建的核心种质均优于R策略。SANA和SAGD法抽取的核心种质对原有种质均具有较好的代表性,但等位基因保留率较低。M策略构建的核心种质等位基因(Na)保留比例明显高于其他3种策略所构建的核心种质。根据遗传多样性参数综合考虑,同时考虑抽样数量,M策略构建的核心种质能以最小的取样量、最大程度地保留原有种质的遗传多样性,为最优的取样策略。……
