忽略种族及生活方式等因素的冠状动脉粥样硬化患者常见基因分析筛查
2017-06-15陈曼丽陈孟辉宫蕊张翠召唐龙妹齐莉莉
陈曼丽 陈孟辉 宫蕊 张翠召 唐龙妹 齐莉莉
·论著·
忽略种族及生活方式等因素的冠状动脉粥样硬化患者常见基因分析筛查
陈曼丽 陈孟辉 宫蕊 张翠召 唐龙妹 齐莉莉
目的 筛选冠状动脉粥样硬化主要相关基因,以指导疾病的早期诊断、远期预防。方法 检测参与冠心病(CAD)发生发展的基因,通过搜索基因表达综合数据库(GEO)收集来自不同大洲的CAD患者的血液样本基因表达研究。对各大洲CAD患者和正常对照组(NC)之间的基因表达的比较分析,确定不同大洲CAD患者和NC之间差异表达基因的普通集合(DEGS)。对差异表达基因通过Cytoscape软件,建立共同的PPI网络。了解其在CAD中的生物学作用。结果 基因库中:亚洲、欧洲和北美洲CAD患者和对照组之间,分别有575个,868个和476个基因被确定为重要的存在差异表达的基因。在三个不同大洲发现24个基因与CAD相关,6个与早起CAD或动脉粥样硬化有关的基因。在PPI网络中重要的枢纽蛋白,包括IRF4(阶=23)、PLAUR(阶=17)和hist1h2ae(阶=15)。结论 忽略民族、种族、生活方式和环境因素的差异,这种检测方式可以为了解CAD的发病机制提供重要的监测手段,并推动诊断标志物和有效的治疗策略的发展。
冠状动脉疾病;不同大陆;基因表达;共同基因
冠心病(CAD),作为一种复杂的慢性疾病,受遗传、环境及生活方式等多种因素影响[1,2]。尽管在CAD的预防和治疗方面取得相当大的进展,但是它的并发症、发病率和死亡率仍然很高[3],在不同的民族有很大的差异。南亚(SA)包括印度、巴基斯坦、孟加拉、或斯里兰卡血统,被认为比其他民族有更高的患冠心病的风险[4,5],可能由于一些特定的感染如结核分支杆和巨细胞病毒感染所致[6]。……
