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利用自制电泳装置模拟电泳实验*

2017-05-12郭琪琦朱立伟赵盼盼

生物学通报 2017年5期
关键词:塑料盒梳子模拟实验

郭琪琦 沈 艺 朱立伟 赵盼盼

(1广东省深圳市第二实验学校 广东深圳 518021 2广东省深圳市坪山新区同心外国语学校 广东深圳 518118 3广东省深圳科学高中 广东深圳 518129 4广东省深圳市横岗高级中学 广东深圳 518115)

电泳技术作为生化实验的重要技术,被广泛应用于分离分析蛋白质、核酸等生物大分子。但由于电泳装置和相关试剂的价格较高,且高中阶段使用频率不高,学校一般不开展电泳实验。在国外相关资料[1]的启发下,本实验通过自制电泳装置和模拟电泳,解决学生无法亲自动手进行电泳实验的问题。

1 自制电泳装置

常规的电泳装置一般由直流电源和电泳槽组成,电泳槽又包括缓冲液槽、电泳介质支架(例如“凝胶托盘”)、点样孔模具(俗称“梳子”) 、电极等。自制电泳装置时,直流电源可由串联电池替代,电泳槽则需利用生活中常见的材料自行制作再组装。

1.1 制作材料 实验室提供器材:9 V电池若干、鳄鱼夹导线、电极(或锡箔)。

自备材料:记号笔、剪刀、防水胶带、塑料盒2个、用于做“梳子”的自选材料。

1.2 制作过程

1.2.1 电源的组装 电泳时需要一个稳定的直流电源,根据凝胶的大小,电源的电压可能需要达到30~150 V以上。根据需要准备相应数量(一般为奇数)的电池,将电池的正、负极接头相互连接串联起来,再连接上导线,电源即组装完成。

1.2.2 缓冲液槽和凝胶托盘的制作 准备 2个大小不同的长方形塑料盒,小塑料盒应能放入大塑料盒中,且留有一定的空隙。大塑料盒用以充当缓冲液槽,小塑料盒用于制作凝胶托盘。凝胶托盘的制作过程如图1所示。

图1 凝胶托盘制作过程

1.2.3 梳子的制作 “梳子”是点样孔模具的俗称,制作凝胶时,将其插入凝胶托盘中,当凝胶固化时就能形成点样孔。

梳子长度应比凝胶托盘宽度至少长2 cm,梳齿之间的间隔在1 cm左右,每个梳齿的直径大约为3~4 mm(若梳齿是正方形或矩形时为等效面积),长度要接近凝胶托盘的深度。可以使用生活中常见的材料制作“梳子”,例如硬纸板和铝箔、一次性筷子和钉子等;也可以直接用日常使用的宽齿梳替代“梳子”。选择自制材料时,应注意材料表面尽可能平滑,以免在拔出梳子时弄破凝胶,破坏点样孔。

1.2.4 组装电泳装置 电泳时,电泳槽要与电源相连,因此电泳槽要安装电极。可使用现成的电极,例如碳棒、铜片等;若无现成电极,也可在缓冲液槽(即大塑料盒)的两端包裹铝箔作为电极。将凝胶托盘放入缓冲液槽时,要注意其两端与相应电极之间应保持至少几毫米的距离,不可直接接触。电泳时将电源导线连接到相应电极上即可。

2 模拟电泳实验

2.1 实验原理 由于影响电泳的因素很多,在分离DNA或蛋白质时,需对样品进行不同处理,配制不同的凝胶和缓冲液,采用不同的染色技术。实验不仅过程复杂,且需要的试剂较多,价格不菲。

模拟实验用大分子染料模拟DNA或蛋白质分子。大分子染料在真实的电泳实验中主要充当指示剂,例如常用的指示剂溴酚蓝,在0.6%、1.0%、1.4%和2.0%琼脂糖凝胶电泳中,其迁移率分别与1 Kb、0.6 Kb、0.2 Kb和0.15 Kb的双链线性DNA片段大致相同,因此可根据电泳中形成的指示带预测电泳的速度和位置。在模拟实验中,以分子量不同的染料及染料混合液为样品进行电泳,最终可观察到处于不同位置的条带,从而模拟DNA或蛋白质分子的分离。

综合染料的分子量、酸碱性、水溶性及价格因素,本实验选择碱性染料甲基紫、亚甲基蓝作为样品,使用普通琼脂和自制缓冲溶液,在自制电泳装置中进行分离。

2.2 实验器材与试剂

实验器材:500 mL烧杯(或饮料瓶)、250 mL烧杯(或玻璃杯)、100 mL量筒、药匙(或茶匙)、玻璃棒、滴管、点样板(或薄膜)、牙签、尺子、微波炉、自制电泳装置。

实验试剂:NaHCO3(小苏打)、蒸馏水(或自来水)、琼脂粉、甲基紫、亚甲基蓝、甘油。

2.3 实验过程 模拟实验过程与真实电泳过程相似,借此过程可帮助学生理解电泳原理,初步了解电泳实验操作。自制装置的实验过程见图2。具体过程如表1所示。

图2 自制电泳装置

表1 模拟实验过程

2.4 实验结果 经过30 min的电泳,实验结果如图3所示。

图3 实验结果

结果表明,大分子染料确实在自制的电泳装置中发生了迁移,可以从色带的迁移位置比较染料分子量的大小,混合染料也能够较好地分离。大分子染料确实能模拟DNA或蛋白质分子,而自制的电泳装置也确实能进行电泳实验。

3 本实验在中学课程开发中的应用

3.1 填补国内教材空白 国内高中生物学教材对电泳技术及其应用有一定的介绍,例如选修1《生物技术实践》中课题“血红蛋白的提取和分离”,详细介绍了电泳技术相关原理,并将利用电泳技术鉴定血红蛋白作为选做实验,写明“有条件的学校,可以参考生物化学实验的有关书籍,尝试SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的操作”。学生一方面对教材中的电泳结果图感到好奇,另一方面却没有机会通过实验操作直观地了解电泳过程,对理解电泳技术的原理也存在一定困难。本实验能为学生提供亲自动手进行电泳实验的机会,填补了现行高中教材中关于电泳实验的空白。

3.2 整合为STEAM课程 本实验内容特别适合整合为基于项目学习的STEAM课程模式。教学中可围绕自制电泳装置和模拟实验的项目组织课程,让学生进行设计、动手操作,综合应用生物、化学、物理等学科知识(S),与 STEAM学科的技术(T)、工程(E)、艺术(A)、数学(M)这些跨学科对接融合。在这种模式下要求学生参与、合作、创新、分享,像工程师一样做产品,像科学家一样做研究,因此能更好地培养创新精神与实践能力。

3.3 运用灵活多样的教学形式 本自制实验装置虽为面向高中学生的动手操作,但由于其材料的易获得性、过程的易操作性,成人、手工爱好者、对生物学实验有兴趣者均可以利用现有的家庭条件尝试该操作;教师也可以参考本实验,设计针对高中学生的实验室教学,甚至一系列相关的社团活动。

4 教学建议

结合国内高中教学的实际情况,在应用这一实验进行实际教学时,应注意如下几点:

4.1 结合本地情况寻找替代材料 本实验用生活常见物品代替相关电泳设备,成本低廉,取材方便,操作简单,能够满足课程标准对于电泳技术的要求,既适合在家庭环境中操作,也适合在我国特别是中西部贫困地区中学推广,是一项具有实际意义的实验技术,有利于学生实验能力的培养和科学素养的提高。模拟电泳实验使用甲基紫、亚甲蓝等染料,较真正电泳实验中使用的染料安全简便,但考虑价格和获取途径等实际因素,可以尝试用其他更常见的染料代替。

4.2 操作中的注意事项 虽然是模拟电泳实验,但在实验操作中仍然要遵循电泳实验的相关操作要求,例如凝胶要均匀冷却,防止倒胶过程中产生气泡,染料在样品缓冲液中溶解完全,控制加样量和电泳时间等。

4.3 模拟实验与真实实验关系的处理 在高中阶段,电泳技术对于学生来说并不容易理解,而实际进行电泳实验又难以操作,因而模拟电泳实验能够帮助学生更好地理解电泳技术的原理,掌握电泳实验的操作流程,提高学习兴趣。但模拟实验并不等价于真实实验,教学过程中一定要强调二者的区别。在实验中,需要重点说明染料模拟电泳与DNA、蛋白质电泳的不同,同时结合化学、物理等其他学科知识,对于实验过程中的不同点进行介绍或演示,激发学生的学习兴趣,以便更好地帮助学生理解电泳技术。

主要参考文献

[1]Robert Bruce Thompson, BarbaraFritchman Thompson.DIY science:illustrated guide to home biology experiments:all lab,no lecture.Maker Media,2012.

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