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评价ITS、BenA和CaM序列分析在曲霉菌种鉴定方面的应用

2017-05-10李颖徐英春

中国真菌学杂志 2017年2期
关键词:水平分析

李颖 徐英春

(中国医学科学院北京协和医院检验科 中国医学科学院北京协和医学院研究生院,北京 100730)

·论著·

评价ITS、BenA和CaM序列分析在曲霉菌种鉴定方面的应用

李颖 徐英春

(中国医学科学院北京协和医院检验科 中国医学科学院北京协和医学院研究生院,北京 100730)

目的 评价内转录间隔区 (ITS)、β-微管蛋白基因 (BenA)和钙调蛋白基因 (CaM)序列分析技术对曲霉的鉴定能力。方法 对169株曲霉临床分离株分别进行ITS、BenA和CaM序列测定,并在Genbank数据库中进行比对分析以获得其菌种鉴定信息。结果 169株曲霉经ITS、BenA和CaM序列分析分别有52.7%、66.3%、97.6%菌株鉴定至种水平,47.3%、33.7%、2.4%菌株鉴定至属水平,3个序列对曲霉均不存在无法鉴定情况。结论 ITS、BenA和CaM均可用于曲霉菌种鉴定,其中以CaM的鉴定能力最强。

内转录间隔区 (ITS);β-微管蛋白基因 (BenA);钙调蛋白基因 (CaM);序列分析;曲霉;菌种鉴定

随着罹患自身免疫病、艾滋病、肿瘤等恶性疾病患者数量的不断增多,侵袭性曲霉病在临床的发病率也逐年升高[1-3]。曲霉种类繁多,分类复杂,不同菌种间耐药谱存在一定差别,如土曲霉对抗真菌药两性霉素B天然耐药,烟曲霉复合群中的缓慢曲霉种对大多数临床抗真菌药物敏感性低[4-5]。因此,准确鉴定曲霉菌种对于指导临床用药具有重要意义。目前临床上对曲霉的分类鉴定主要依靠传统的形态学方法,包括直接观察培养菌落形态、颜色、质地以及镜下查找特征性菌丝、孢子等结构。该方法鉴定能力不足,且对鉴定人员的经验及技术要求较高[6]。……

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