邹 伟，王 敏，陶佳妮，姚 娣，李 赟，王雪松，沈汪洋,2*

(1.武汉轻工大学 食品科学与工程学院，湖北 武汉 430023； 2.大宗粮油精深加工省部共建教育部重点实验室，湖北 武汉 430023)

β-环糊精抑制α-半乳糖苷酶的动力学模拟

邹 伟1，王 敏1，陶佳妮1，姚 娣1，李 赟1，王雪松1，沈汪洋1,2*

(1.武汉轻工大学 食品科学与工程学院，湖北 武汉 430023； 2.大宗粮油精深加工省部共建教育部重点实验室，湖北 武汉 430023)

为进一步了解β-环糊精与α-半乳糖苷酶的作用机制，在前、中期采用同源建模、分子对接的基础上，采用对复合物体系进行分子动力学模拟，并计算出均方根偏差、温度、密度以及总能量四个衡量指标，对体系动力平衡的稳定程度进行评价，得到了动力学模拟轨迹是稳定的结果，再采用MMPBSA能量计算及分解的方法，对β-环糊精与α-半乳糖苷酶之间的相互作用进行能量计算，确定了两者的结合是一个自发的过程，且能够达到一个稳定的状态，并得到了β-环糊精对α-半乳糖苷酶的抑制作用主要是由范德华相互作用能和静电作用能产生的结论。

β-环糊精；α-半乳糖苷酶；分子动力学模拟；MMPBSA能量计算

1 引言

β-环糊精(β-cyclodextrin)是由7个α-D-吡喃葡萄糖单元通过α-1,4糖苷键连接而成的环状低聚糖，具有一个环外亲水、环内疏水且具有一定尺寸的立体手性空腔[1]。α-半乳糖苷酶(α-galactosidase, EC 3.2.1.22)是一种外切糖苷酶，主要作用对象是具有α-半乳糖苷结构的碳水化合物[2-3]。

咖啡豆α-半乳糖苷酶是α-半乳糖苷酶的一种,从咖啡豆中提取得到[4-7]，咖啡豆α-半乳糖苷酶能把α-半乳糖基直接转移到β-环糊精的环上，形成新的分支环糊精：α-半乳糖基-β-环糊精[8-9](α-galactosyl-β-cyclodextrin)。……