美国“百万老兵计划”大数据管理及其启示
2017-03-21,
中华医学图书情报杂志 2017年4期
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英国、美国、中国相继开展了基于大规模人群队列的精准医学计划[1-3],数据规模达百万级,多来源、多类型的大数据协调及管理成为精准医学研究和应用的新挑战。为了更深入了解面向精准医学的大规模人群队列数据管理方法和关键技术,本文主要介绍了美国“百万老兵计划”(Million Veteran Program,MVP)。它是一项国家级研究计划,由美国退伍军人事务部负责实施,目标是为了帮助研究人员更好地理解基因组对健康和疾病的影响,用于改善退伍军人的医疗健康及对特定疾病(糖尿病、癌症等)进行有效预防、诊断和治疗[4]。
该计划启动于2011年,截至2016年7月,已在美国范围内的50多个站点招收了超过500 000的退伍军人参与研究,并建立了美国国家级最大的存储关联遗传、临床、生活方式和军事暴露等多种信息的数据库。该计划已支持完成超过175项有关心脏病、癌症、心理健康和许多其他疾病危险因素或治疗方法的研究评估[5],在其开展过程中所积累的大量基础数据、临床数据等也成为奥巴马提出的美国精准医学计划的重要数据来源。
MVP在人群招募、接收、数据采集、保存、数据协调管理、数据分析、数据安全和数据访问的过程中,采取了较为系统和有效的组织管理措施、定义了明确的数据流程规范和指导方针,构建了关于基因、部队经历、生活方式和健康信息的数据库和集成数据管理系统,值得超大规模人群队列数据管理研究借鉴和参考。
1 大规模数据采集
1.1 采集对象
MVP主要招募军人志愿者作为研究对象,所有参与者均为曾经使用过美国退伍军人事务部医疗系统的退伍军人,自愿共享他们的医疗健康信息和基因信息。……
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