胡世贤，陆佳涛，徐福意，晁天柱，周梁良，李凯，周宇荀，肖君华

(东华大学生物科学与技术研究所，上海 201620)

利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因

胡世贤，陆佳涛，徐福意，晁天柱，周梁良，李凯，周宇荀，肖君华*

(东华大学生物科学与技术研究所，上海 201620)

目的 基于表达谱芯片的检测结果，筛选多个内参基因，用于小家鼠肝脏组织中具有不同表达丰度基因的定量检测。方法 应用表达谱芯片技术，完成小鼠肝脏组织的表达谱检测；依据基因表达丰度将基因分为3组，并进一步通过变异系数(coefficient of variation, CV)组内筛选候选内参基因；采用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative polymerase chain reaction, qPCR)和geNorm软件确定内参基因。结果 表达谱芯片成功采集超过60000个小鼠肝脏组织中转录本的表达量数据，并将之分为低、中、高3个组合。最终筛选了低表达Casp2和Lrrc14、中表达Nrd1和Trpc4ap、高表达Atp5a1和Clu，共6个内参基因。结论 基于表达谱芯片数据筛选的6个内参基因，可适用于qPCR技术准确定量小家鼠肝组织转录组中不同表达丰度基因的表达量。

内参基因；表达谱芯片；实时荧光定量PCR；geNorm软件

血脂水平异常是动脉粥样硬化、心脏病和脂肪肝密切相关的重要危险因素[1]。随着系统遗传学的蓬勃发展，研究者们利用高血脂小鼠模型，结合基因组学、转录组学、表型组学等知识，在血脂相关遗传学研究中取得了丰硕的成果[2]。其中，基因表达分析在转录组水平上，是研究血脂等复杂性状不可或缺的方法[3]。常用的技术如基因表达谱芯片，操作方便，通量高，可准确快速得到完整的全基因组表达丰度数据，但是昂贵的价格限制了其应用。……