钱荷英++李刚++何庆玲++罗旭芳++徐安英

摘要：首先在GenBank中下载蓖麻蚕核型多角体（PhcyNPV）全基因组序列，通过生物信息学的方法预测表明，PhcyNPV 基因组中有142条miRNA成熟体分子；再用miRanda、RNAhybird 2个软件预测miRNAs对病毒自身的靶基因，提取有共同交集的33条miRNA。用PhcyNPV感染蓖麻蚕，取感病蓖麻蚕的脂肪体组织，提取总RNA；用逆转录PCR（reverse transcription PCR，简称RT-PCR）验证有共同交集的33条miRNA，确定其中6条为miRNA成熟体序列，分别是Phcy-miR-996_5p、Phcy-miR-696-5P、Phcy-miR-664_3p、Phcy-miR-30_5p、Phcy-miR-217_5p、Phcy-miR-1483_3p。这6条可能的miRNA对应的靶基因涉及病毒的融合蛋白、多角体蛋白等结构蛋白，以及一些蛋白激酶包括激活解旋酶表达的极早期基因等，推测其潜在的靶基因参与病毒复制及侵染的重要过程。

关键词：蓖麻蚕；核型多角体病毒；miRNA；生物信息学

中图分类号： S885.25文献标志码： A

文章编号：1002-1302（2016）10-0053-09

收稿日期：2015-09-02

基金项目：现代农业产业技术体系建设专项（编号：CARS-22）。

作者简介：钱荷英（1971—），女，江苏溧阳人，博士，副研究员，主要从事家蚕遗传育种与分子生物学研究。E-mail：qianheying123@163.com。

通信作者：徐安英，研究员，主要从事家蚕遗传育种与种质资源研究。E-mail：srixay@126.com。

[ZK）]

miRNA是一类大小约22 nt的单链小分子RNA，由具有发夹结构的长约70～90个碱基的单链RNA前体经过Dicer酶加工得到，能够和互补或部分互补的靶mRNA的3′末端非翻译区（3′-UTR）结合，选择性降解mRNA或抑制基因翻译[1]。自miRNA被发现以来，迅速成为生命科学领域的研究热点，因此开展miRNA的研究将对转录后基因调控领域的发展产生深远影响。

病毒miRNA产生过程与其他生物类似，其成熟miRNA大小和结构也与其他生物的miRNA一致。病毒miRNA不仅可调节自身基因的表达，利于病毒复制及潜伏感染，还能调节宿主基因的表达并因此逃避宿主的免疫作用[2]。……