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生物胁迫相关NAC1转录因子的生物信息学分析

2017-02-05朱峰陈孝仁钱坤纪兆林孔维

江苏农业科学 2016年10期

朱峰++陈孝仁++钱坤++纪兆林++孔维文++杨益众

摘要:植物NAC1转录因子在调控植物的抗生物胁迫反应中起着重要的作用。为探究生物逆境相关NAC1转录因子的功能,通过生物信息学的方法对8个生物逆境胁迫相关NAC1蛋白氨基酸序列一致性、氨基酸组成、理化性质、亲/疏水性、保守结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构及三级结构等进行了预测和分析。结果表明,8个生物逆境胁迫相关NAC1蛋白N-端保守性较强,包括5个保守的亚结构域,共同组成NAC1结构域。C-端含有多个保守的氨基酸,具有转录激活功能。同时蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点。8个NAC1蛋白都为亲水性蛋白,大多定位于细胞核,个别定位于细胞质或叶绿体。二级结构则以α-螺旋和β-折叠为主。8个NAC1蛋白三维结构上的相似性暗示了功能上存在相似。本研究结果为进一步挖掘生物逆境相关NAC1转录因子的功能和改良植物抗生物逆境特性提供理论依据。

关键词:生物胁迫;NAC1转录因子;生物信息学;抗生物逆境特性

中图分类号: Q78文献标志码: A

文章编号:1002-1302(2016)10-0043-06

收稿日期:2016-04-14

基金项目:国家自然科学基金(编号:31500209);江苏省高校自然科学研究面上项目(编号:15KJB210007);江苏省扬州市自然科学基金-青年科技人才项目(编号:YZ2015106)。

作者简介:朱峰(1985—),男,江西九江人,博士,讲师,主要从事植物病理与分子生物学研究。E-mail:zhufeng@yzu.edu.cn。

[ZK)]

NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族是目前发现的最大的一类植物特有的转录因子,在其他真核生物中尚未发现该家族成员[1-2]。NAC家族的命名源……

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