虾脊兰属植物DNA条形码的确立
2017-01-09任阳阳张梦婷张嘉丽樊佳佳张晓存
任阳阳 张梦婷 张嘉丽,2 樊佳佳 张晓存 王 俊,2 刘 霞,2
(1 武汉理工大学化学化工与生命科学学院,武汉,430070; 2 中国中医科学院中药研究所,北京,100700)
虾脊兰属植物DNA条形码的确立
任阳阳1张梦婷1张嘉丽1,2樊佳佳1张晓存1王 俊1,2刘 霞1,2
(1 武汉理工大学化学化工与生命科学学院,武汉,430070; 2 中国中医科学院中药研究所,北京,100700)
目的:结合ITS2、psbA-trnH和matk序列对兰科虾脊兰属植物进行物种区分鉴定研究,并确立能准确鉴别虾脊兰属植物的序列或者序列组合。方法:采用试剂盒法对已收集的6种虾脊兰属植物进行总DNA的提取,通过扩增及测序,运用codencodeV4.2软件对所得序列进行拼接与剪切,使用MEGA5.0对ITS2、psbA-trnH和matk序列3种序列分别进行比对分析,计算种内及种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,构建Neighbor-joining(NJ)系统聚类树。结果:实验共得到序列56条(包含GenBank序列17条),ITS2序列和matK序列其种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,而该属psbA-trnH序列种内遗传距离范围和种间遗传距离范围有重合。结论:ITS2序列和matK序列可以作为虾脊兰属部分植物的鉴定序列,而psbA-trnH序列不能用于虾脊兰属植物的鉴定。
DNA条形码;ITS2;psbA-trnH;matK;虾脊兰属
虾脊兰属(CalantheR.Br.)为兰科地生草本植物,据《中国植物志》中记载,虾脊兰属植物全属约150种,分布于亚洲热带和亚热带地区、新几内亚岛、澳大利亚、热带非洲以及中美洲等地。虾脊兰属植物有“兰中西施”的美称,可见其具有极高的观赏价值,而该属植物不仅外表绚丽还颇有药用价值,在民间多做药用,据文献记载,虾脊兰属植物具有活血止痛、清热解毒等功效[1],据报道,虾脊兰的酶水解产物为tryptanthrin,indirudin和isatin,这些水解产物在原植物中也存在,它们均具有抗白血病的作用。……
