基于质谱技术应用CLINPROT系统建立乳腺癌诊断模型*
2017-01-06陈英剑胡成进
杨 帆,陈英剑,胡成进△
(1.锦州医科大学研究生院,辽宁锦州 121001;2.济南军区总医院实验诊断科,济南 250031)
·论 著·
基于质谱技术应用CLINPROT系统建立乳腺癌诊断模型*
杨 帆1,陈英剑2,胡成进2△
(1.锦州医科大学研究生院,辽宁锦州 121001;2.济南军区总医院实验诊断科,济南 250031)
目的 应用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROT)系统筛选乳腺肿瘤患者血清中潜在的肿瘤标志物,并基于差异蛋白建立乳腺癌诊断预测模型。方法 收集病理确诊的乳腺癌患者血清标本43例及健康女性血清标本24例,并随机分为建模组和验证组。应用ClinProt Tools系统对建模组中的乳腺癌患者和健康女性血清进行差异蛋白的筛选,建立差异蛋白质图谱,应用ClinProTools v3.0 软件建立乳腺癌诊断预测模型,而后利用该诊断模型对验证组血清标本进行分组验证,初步评估该模型的诊断效能。结果 通过分析病例组和对照组质谱峰信息,得到24个具有明显差异的蛋白峰(P<0.05)。根据遗传算法选取表达差异最显著的3个蛋白质建立乳腺癌诊断预测模型,该模型对建模组乳腺癌的识别能力为91.67%。后利用验证组标本对该模型的诊断效能进行评估,结果显示其对验证组乳腺癌识别准确率为85.7%。 结论 利用ClinProt Tools v3.0软件成功建立并评估了乳腺癌诊断预测模型,为乳腺癌诊断提供了新的途径。
液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术; 乳腺癌; 诊断模型
液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROT)系统是由德国布鲁克道尔顿公司基于质谱开发的蛋白质组学分析和鉴定系统。该系统主要由4个子系统组成:磁珠富集低丰度蛋白质/多肽、质谱采集、CLINPROT软件和体液样品自动处理系统。基本过程:将患者或健康对照的临床样品通过磁珠进行分离,去除样品中的高丰度蛋白和杂质,将分离后的蛋白质/多肽样本与基质混合后,直接点在抛光靶上,通过MALDI TOF/TOF MS进行分析,得到两组蛋白的总质谱图,通过CLINPROT系统比较病例组与对照组表达差异的蛋白,生成平均质谱图、胶状图等,用于临床未知样品的预测[1]。……
