基于ISSR标记的钩栗遗传多样性分析
2016-12-21田艳伶李志辉
田艳伶,李志辉
(1.中南林业科技大学 林学院,湖南 长沙 410004;2.益阳市林业科学研究所,湖南 益阳 413000)
基于ISSR标记的钩栗遗传多样性分析
田艳伶1,2,李志辉1
(1.中南林业科技大学 林学院,湖南 长沙 410004;2.益阳市林业科学研究所,湖南 益阳 413000)
利用 ISSR分子标记对钩栗Castanopsis tibetanaHance 9个野生居群进行了遗传多样性分析。利用100条引物分别对111份钩栗基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出158条清晰条带,其中多态性条带141条,多态性条带百分率(P)平均为89.01%。钩栗9个居群的Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数分别为0.332 3、0.492 0;总种群基因多样度(Ht)、各种群基因多样度分别为(Hs)0.410 8、0.334 6,表明钩栗的遗传多样性较高。9居群的基因分化系数Gst为 0.185 5,占总遗传多样性的 81.45%。分子方差分析表明,80.21%的遗传差异存在于群体内,19.79%的遗传差异存在于群体间。基因流为2.196 0。用NTSYS 软件计算出9居群111材料的DICE相似系数在0.811 6~0.921 8 之间,遗传亲缘关系较近。各居群间的遗传距离差异较大;其中,邵武与建瓯居群的遗传距离最近,仅为0.081 5; 浏阳和周宁居群的遗传距离最远,为 0.198 4。聚类分析结果表明,采自福建的邵武、建瓯、建阳、屏南和周宁居群聚在一起;恩施和桑植居群聚在一起;永顺和浏阳居群聚为一起,种群遗传变异分布模式基本上与其地理生态格局一致。研究结果表明:供试的钩栗具有较高的遗传多样性,存在着较为频繁的基因交流;基于 ISSR 标记分析能较准确地揭示出钩栗种间的遗传多样性。
钩栗;ISSR标记;遗传多样性;基因分化;聚类分析
钩栗Castanopsis tibetanaHance为壳斗科锥属树种,又名钩锥,钩栲。为常绿阔叶高大乔木,树冠浑厚,叶大荫浓,高达30 m;……
