肿瘤干细胞中受H3K9me2调控的干性基因的筛选
2016-12-12陶虹张绍平张琳娜张漫扈启宽
陶虹张绍平张琳娜张漫扈启宽,
(1. 宁夏医科大学基础医学院生理学系,银川 750004;2. 宁夏颅脑疾病重点实验室 国家重点实验室培育基地,银川 750004)
肿瘤干细胞中受H3K9me2调控的干性基因的筛选
陶虹1张绍平2张琳娜1张漫1扈启宽1,2
(1. 宁夏医科大学基础医学院生理学系,银川 750004;2. 宁夏颅脑疾病重点实验室 国家重点实验室培育基地,银川 750004)
为了分析比较甲基转移酶G9a和组蛋白H3K9me2修饰在胶质瘤干细胞与非干细胞中存在的差异,筛选出维持胶质瘤干细胞干性的相关基因。通过G9a抑制剂促进U87细胞成球和过表达G9a促进U87细胞分化的方法,培养了成球的胶质瘤干细胞和贴壁的非干细胞,这两种细胞的CD133表达差异明显。再利用H3K9me2抗体通过ChIP-seq技术比较H3K9me2修饰在干细胞组与非干细胞组中的差异,在存在差异的基因中,对TSS±2 000 bp范围内的基因进行了GO分析,并随机选出10个转录因子进行QPCR验证,结果与ChIP-seq实验基本一致。
ChIP-seq;G9a;H3K9me2;Bix01294;U87细胞株
自我复制是干细胞所特有的特性,在保持高度增殖能力的同时还能维持子代细胞处于不分化状态,并保持其多向分化潜能。肿瘤干细胞广泛存在于各种肿瘤中[1-6],也具有自我复制和多向分化的特性,并表达多种干细胞的标志分子,如CD34、CD133、ALDH1、CXCR4、Nestin、LRCs等。肿瘤干细胞一般处于休眠或者低增殖状态,但受到内、外因素刺激后,便可被活化进入自我复制和增殖状态,成为肿瘤发生的“种子 ”[7]。
组蛋白H3K9(dimethylated histone H3 lysine 9)甲基化修饰是发生在组蛋白H3的9位赖氨酸残基上的甲基化,与基因沉默相关[8]。在胚胎干细胞中,H3K9甲基化修饰的基因仅占基因组4%;……
