马宇欣, 李世访

(中国农业科学院植物保护研究所, 北京 100193)



特约稿件

高通量测序技术在鉴定木本植物双生病毒中的应用

马宇欣, 李世访*

(中国农业科学院植物保护研究所, 北京 100193)

高通量测序技术(next-generation sequencing, NGS)平台提供了一种高效、快速、低成本、深度测序DNA的解决方案,2009年该技术开始被应用于植物病毒学领域,包括新病毒的发现,病害病原的鉴定,病毒基因组多样性及进化的研究,显著加快了植物病毒学的发展进程。迄今,应用高通量测序技术已经成功鉴定了上百种新的植物病毒和类病毒。双生病毒是一类对多种作物造成毁灭性危害的DNA病毒,多发生于草本作物。然而利用高通量测序技术,从柑橘、葡萄、苹果和桑树等多种多年生木本植物中检测到了新的双生病毒,显示出了高通量测序技术所独有的、传统检测技术所不具备的优势。本文围绕高通量测度技术在植物病毒学领域的应用进行概述,重点阐述NGS用于检测木本植物双生病毒的几个实例。

高通量测序; 双生病毒; 植物病毒诊断; 木本植物

1 高通量测序技术

1.1 高通量测序平台的建立及应用

2005年,传统的桑格测序技术 (Sanger sequencing)遭遇了革命性的冲击,更准确、更快速的高通量测序技术诞生了[1]。美国罗氏公司的Roche 454测序平台的推出,开创了高通量测序的先河,此后,美国Illumina公司和ABI公司相继推出Solexa[2]和SOLiD[3-4]测序技术。高通量测序技术的诞生是基因组学领域一个具有里程碑意义的事件[5-7],为现代生命科学的研究提供了前所未有的机遇[8]。……