Chapaev转座子与Transib转座子与RAG1基因起源与进化的关系
2016-11-30张化浩张小谷
张化浩, 熊 敏, 张小谷*
(1.九江学院 药学与生命科学学院, 江西 九江 332000; 2.九江学院 临床医学院, 江西 九江 332000)
Chapaev转座子与Transib转座子与RAG1基因起源与进化的关系
张化浩1, 熊 敏2, 张小谷1*
(1.九江学院 药学与生命科学学院, 江西 九江 332000; 2.九江学院 临床医学院, 江西 九江 332000)
重组激活蛋白基因(recombination activating gene,RAG)是脊椎动物内特有的一类基因,在脊椎动物T细胞受体和免疫血球素基因的重排与重组过程中扮演着关键角色.基于V(D)J重组和DNA转座子重组机制的相似性,研究人员提出了“RAG转座子”模型.本文通过序列比对,发现RAG1与Chapaev转座子整条序列(包括N端及C端)都有一定的相似性.基于它们的N端及C端分别构建系统发生树,结果显示RAG1的N末端可能起源于与Chapaev转座子关系更近的转座子,而RAG1的C末端可能起源于与Transib转座子关系更近的转座子.故此,本文提出了两种RAG1基因可能的起源模型,以期为RAG1基因的起源与进化研究提供一定参考.
RAG1;Chapaev;Transib; 起源和进化
有颌脊椎动物的免疫系统可以通过对外来抗原特定的应答识别消灭外来入侵者,如细菌和病毒.一般通过免疫细胞B和T的表面受体识别这些抗原.由于大量的免疫细胞的表面受体并不能由单一基因直接编码,故有颌脊椎动物的祖先采用了一种简洁的组合方式来解决这个问题[1].免疫细胞表面受体基因的可变部分通常由单独的变量(variable, V)、多样性(diversity, D)以及连接(joining, J)共3部分基因片段进行重组,组装在一起形成具有转录功能的单位,即所谓V(D)J重组过程.在V(D)J重组过程中,每一个V、D和……