实时荧光定量PCR法检测草莓镶脉病毒
2016-11-28苗立祥荣宁宁张豫超杨肖芳张慧琴蒋桂华
苗立祥,荣宁宁,2,张豫超,杨肖芳,张 琴,张慧琴,蒋桂华,*
(1.浙江省农业科学院 园艺研究所,浙江 杭州 310021; 2.浙江师范大学 化学与生命科学学院,浙江 金华 321004; 3.舟山市定海区农业技术推广中心站,浙江 舟山 316000)
实时荧光定量PCR法检测草莓镶脉病毒
苗立祥1,荣宁宁1,2,张豫超1,杨肖芳1,张 琴3,张慧琴1,蒋桂华1,*
(1.浙江省农业科学院 园艺研究所,浙江 杭州 310021; 2.浙江师范大学 化学与生命科学学院,浙江 金华 321004; 3.舟山市定海区农业技术推广中心站,浙江 舟山 316000)
为了建立一种特异、灵敏、快速检测草莓镶脉病毒(Strawberryveinbandingvirus,SVBV)的SYBR Green-Ⅰ实时荧光定量PCR方法,根据已有的检测SVBV的引物信息,合成引物,对不同草莓品种进行PCR扩增。经过克隆、测序及序列比对得到了感染SVBV的阳性植株,利用此植株PCR扩增产物构建重组质粒作为标准品,优化了PCR反应体系,标准曲线的循环阈值(Ct值)与模板浓度有良好的线性关系(R2=0.999 1);进行了灵敏度和重复性试验,敏感性可达到101拷贝·μL-1,约为普通PCR的1 000倍,重复性好;并与常规PCR方法进行了比较,成功建立了检测SVBV的实时荧光定量PCR法。用该方法检测了部分草莓品种的DNA样品,结果表明,大部分植株都带有SVBV。该方法具有很高的灵敏性和重复性,可用来快速检测草莓植株是否感染SVBV。
草莓镶脉病毒;SYBR Green-Ⅰ;实时荧光定量PCR
目前,草莓(Fragaria×ananassaDuch.)生产上用的种苗主要以匍匐茎繁殖为主,即常将上一年的生产株作为母株进行种苗生产。这样经过多年的生产和繁育后,草莓植株很容易感染上病毒,一旦感染病毒便会世代相传,导致植株矮化,匍匐茎发生减少,果实品质变劣,产量严重下降。……
