八眉猪SLA-DRA基因第2外显子多态性分析
2016-11-28谭小音王国梅刘丽霞
金 丽,谭小音,母 童,王国梅,张 丽,刘丽霞
(西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730030)
八眉猪SLA-DRA基因第2外显子多态性分析
金 丽,谭小音,母 童,王国梅,张 丽,刘丽霞*
(西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730030)
为了解八眉猪SLA-DRA基因第2外显子的多态性,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对八眉猪SLA-DRA基因第2外显子进行分型,并对不同等位基因进行核苷酸与氨基酸序列分析。结果显示,222头八眉猪中共检出2种等位基因(A和B)和3种基因型(AA,BB和AB),其中A等位基因和AA基因型的频率最高,为优势基因和优势基因型。对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,发现该基因仅有一个核苷酸突变位点(c.3093 A→C),为错义突变,使甲硫氨酸(Met)变为亮氨酸(Leu),并且该氨基酸位于抗原结合位点上。群体遗传学分析发现,八眉猪遗传杂合度(He)为0.351 4,多态信息含量(PIC)为0.308 8,且经χ2适合性检验,八眉猪在此位点上没有偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。八眉猪SLA-DRA基因第2外显子的多态性较低。
八眉猪;SLA-DRA基因;PCR-SSCP
八眉猪也叫互助猪,属于西北高原地区类型的一个八眉猪系,是青海地方优良猪品种,产仔数多、哺乳性能好、适应性强,耐粗饲,经过长期的自然选择和人工选择,八眉猪能够抗寒、耐热、抗病、适应低营养和粗纤维饲料,是遗传性状稳定、对近交有抗力的地方特色纯种猪[1]。八眉猪与引进的3种瘦肉型猪种(大白、杜洛克、长白)进行二元、三元杂交表现出明显的杂种优势[2-4],是培育高原特色瘦肉型猪新品系的基础猪种[5]。主要组织相容性抗原复合体(……
