烟台黑猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析
2016-11-24王国梅杨启瑞张海龙田晓静刘丽霞
母 童,王国梅,杨启瑞,金 丽,张海龙,张 丽,田晓静,刘丽霞
(西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730030)
烟台黑猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析
母 童,王国梅,杨启瑞,金 丽,张海龙,张 丽,田晓静,刘丽霞*
(西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730030)
采用PCR-RFLP方法对烟台黑猪DQB基因外显子2的多态性进行研究,并对该位点与仔猪腹泻的关联进行了分析。结果表明,在烟台黑猪DQB基因外显子2上共检测出4种等位基因(A、B、C、D),7种RFLP带型(AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD),该位点具有较丰富的多态性。卡方适合性检验显示,烟台黑猪的DQB基因外显子2没有达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。最小二乘法分析结果表明,烟台黑猪的性别和DQB外显子2的基因型均对仔猪腹泻无显著影响(P>0.05),而性别与基因型的互作效应对仔猪腹泻具有极显著的影响(P<0.01),在公猪群体中,AD基因型仔猪腹泻评分高于AA基因型个体(P<0.05),在母猪群体中BB、AC、BC、CC基因型仔猪腹泻评分高于其他基因型仔猪(P<0.05)。
烟台黑猪;SLA-DQB;仔猪腹泻;PCR-RFLP;多态性
主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)是染色体上的一个多基因家族,由紧密连锁、高度多态的基因座组成,具有抗原递呈作用。MHC在猪中存在于7号染色体的短臂上[1],被称为猪白细胞抗原(swine leukocyte antigen, SLA)复合体,主要分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类基因。SLA在1970年首次被发现,其研究地位仅次于人类MHC,尤其是SLAⅡ类基因的研究[2-3]。SLAⅡ类基因约由18个基因序列所组成(DQB、DRB、DRA、DQA、DPB、DPA、DZA及DOB等),在控制机体的免疫应答与免疫调节中起着重要作用,与猪的抗病能力密切相关。研究发现,在较多的Ⅱ类基因中编码β1结构域的SLA-DQB基因外显子2存在高度多态性,在国内这一领域已经成为近些年研究的热点之一[4-9]。方美英等[10]对小梅山、大约克及中梅山猪采用PCR-RFLP法进行分析,结果在中梅山猪中检测到4种等位基因,小梅山猪中共检测到2种基因型。……
