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大豆5个新发现ERF基因的生物信息学及表达分析

2016-11-24高士童孙婉姝任巍巍王秀文王玉书

浙江农业学报 2016年10期
关键词:大豆植物

翟 莹,张 军,赵 艳,高士童,孙婉姝,张 闯,任巍巍,王秀文,王玉书

(1.齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006; 2.黑龙江省兽医科学研究所,黑龙江 齐齐哈尔 161005)



大豆5个新发现ERF基因的生物信息学及表达分析

翟 莹1,张 军2,赵 艳1,高士童1,孙婉姝1,张 闯1,任巍巍1,王秀文1,王玉书1

(1.齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006; 2.黑龙江省兽医科学研究所,黑龙江 齐齐哈尔 161005)

ERF转录因子广泛存在于植物中并且参与植物对生物及非生物胁迫的响应。从NCBI数据库中获得5个新的ERF基因,GmERFa/b/c/d/e。蛋白序列分析显示,5个ERF基因均含有一个保守的AP2/ERF结合域。进化分析表明,GmERFe与GmERF3和GmERF7同源性最高,GmERFb、GmERFc与GmERF5的同源性最高,GmERFd与GmEREBP1的同源性较高,而GmERFa与其他ERF蛋白的同源性均较低。实时荧光定量PCR结果显示,5个基因都主要在大豆的根和叶中表达。逆境处理后的实时荧光定量PCR结果显示,GmERFd/e主要对乙烯信号和低温产生响应,GmERFb主要对干旱产生响应,而GmERFa主要对低温产生响应。

大豆;ERF转录因子;生物信息学分析;表达分析

乙烯响应因子(ethyleneresponsefactor,ERF)基因以家族形式广泛存在于植物中,隶属于AP2/ERF超家族。它们功能多样,不仅在植物的生长和发育过程中发挥功能,更在植物应对不良环境时发挥重要作用[1-3]。ERF转录因子家族的成员都含有一段由58或59个氨基酸残基组成的保守序列,即ERF的DNA结合域。ERF转录因子能够识别并结合GCC-box、DRE/CRT等顺式作用元件就取决于DNA结合域中特定的氨基酸序列,而这些顺式作用元件则通常位于胁迫相关的启动子中[4-7]。……

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